Identificación a Nivel del Genoma y Análisis de Expresión de Genes en Pepino (L.)
Autores: Zhang, Mengying; Zhang, Wenyan; Zheng, Zijian; Zhang, Zhiping; Hua, Bing; Liu, Jiexia; Miao, Minmin
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Identificación a Nivel del Genoma y Análisis de Expresión de Genes en Pepino (L.)
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Transportador de nitratos
Transportador de péptidos
Genes de pepino
Análisis filogenético
Perfiles de expresión génica
Estrés abiótico
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 10
Citaciones: Sin citaciones
La familia de proteínas TRANSPORTADOR DE NITRATO 1/TRANSPORTADOR DE PEPTIDOS (NPF) desempeña un papel esencial en la regulación de la absorción y distribución de nitrato en las plantas y en la mejora de la eficiencia del uso de nitrógeno en las plantas. En este estudio, se analizaron de manera exhaustiva los genes de pepino (L.) a nivel de genoma completo, y se encontró que 54 genes estaban distribuidos de manera desigual en siete cromosomas del genoma de pepino. El análisis filogenético mostró que estos genes podían dividirse en ocho subfamilias. Renombramos todos los genes de acuerdo con la nomenclatura internacional, basada en su homología con otros genes. Al examinar los perfiles de expresión de los genes en varios tejidos, encontramos que se expresaba específicamente en raíces, lo que indica que podría desempeñar un papel en la absorción de N; se expresó en gran medida en los pecíolos, lo que podría estar relacionado con el almacenamiento de NO en los pecíolos; y se expresó en gran medida en los frutos, lo que podría promover el transporte de NO a los embriones. Además, examinamos sus patrones de expresión bajo diferentes condiciones de estrés abiótico y de nitrógeno, y encontramos que respondieron al estrés por sal, frío y bajo nitrógeno. En conjunto, nuestro estudio sienta las bases para una exploración más profunda de las funciones moleculares y fisiológicas de los transportadores de nitrato de pepino.
Descripción
La familia de proteínas TRANSPORTADOR DE NITRATO 1/TRANSPORTADOR DE PEPTIDOS (NPF) desempeña un papel esencial en la regulación de la absorción y distribución de nitrato en las plantas y en la mejora de la eficiencia del uso de nitrógeno en las plantas. En este estudio, se analizaron de manera exhaustiva los genes de pepino (L.) a nivel de genoma completo, y se encontró que 54 genes estaban distribuidos de manera desigual en siete cromosomas del genoma de pepino. El análisis filogenético mostró que estos genes podían dividirse en ocho subfamilias. Renombramos todos los genes de acuerdo con la nomenclatura internacional, basada en su homología con otros genes. Al examinar los perfiles de expresión de los genes en varios tejidos, encontramos que se expresaba específicamente en raíces, lo que indica que podría desempeñar un papel en la absorción de N; se expresó en gran medida en los pecíolos, lo que podría estar relacionado con el almacenamiento de NO en los pecíolos; y se expresó en gran medida en los frutos, lo que podría promover el transporte de NO a los embriones. Además, examinamos sus patrones de expresión bajo diferentes condiciones de estrés abiótico y de nitrógeno, y encontramos que respondieron al estrés por sal, frío y bajo nitrógeno. En conjunto, nuestro estudio sienta las bases para una exploración más profunda de las funciones moleculares y fisiológicas de los transportadores de nitrato de pepino.