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Identificación a Nivel del Genoma y Análisis de Expresión de Genes en Pepino (L.)

Autores: Zhang, Mengying; Zhang, Wenyan; Zheng, Zijian; Zhang, Zhiping; Hua, Bing; Liu, Jiexia; Miao, Minmin

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2023

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Acceso abierto

Artículo científico
2023

Identificación a Nivel del Genoma y Análisis de Expresión de Genes en Pepino (L.)


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Botánica

Palabras clave

Transportador de nitratos
Transportador de péptidos
Genes de pepino
Análisis filogenético
Perfiles de expresión génica
Estrés abiótico

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 10

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
La familia de proteínas TRANSPORTADOR DE NITRATO 1/TRANSPORTADOR DE PEPTIDOS (NPF) desempeña un papel esencial en la regulación de la absorción y distribución de nitrato en las plantas y en la mejora de la eficiencia del uso de nitrógeno en las plantas. En este estudio, se analizaron de manera exhaustiva los genes de pepino (L.) a nivel de genoma completo, y se encontró que 54 genes estaban distribuidos de manera desigual en siete cromosomas del genoma de pepino. El análisis filogenético mostró que estos genes podían dividirse en ocho subfamilias. Renombramos todos los genes de acuerdo con la nomenclatura internacional, basada en su homología con otros genes. Al examinar los perfiles de expresión de los genes en varios tejidos, encontramos que se expresaba específicamente en raíces, lo que indica que podría desempeñar un papel en la absorción de N; se expresó en gran medida en los pecíolos, lo que podría estar relacionado con el almacenamiento de NO en los pecíolos; y se expresó en gran medida en los frutos, lo que podría promover el transporte de NO a los embriones. Además, examinamos sus patrones de expresión bajo diferentes condiciones de estrés abiótico y de nitrógeno, y encontramos que respondieron al estrés por sal, frío y bajo nitrógeno. En conjunto, nuestro estudio sienta las bases para una exploración más profunda de las funciones moleculares y fisiológicas de los transportadores de nitrato de pepino.

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