La toxicidad por metales pesados conduce a un crecimiento deficiente de los cultivos y a una reducción en los rendimientos y la calidad del producto al interrumpir la absorción de nutrientes por las plantas, inhibir el desarrollo, inducir estrés oxidativo y causar toxicidad celular. Los hongos micorrízicos arbusculares (HMA) pueden desempeñar un papel crucial en la adaptación de los cultivos a la toxicidad por manganeso (Mn) al regular la absorción de nutrientes y alterar la compartimentalización subcelular. El presente estudio examina la influencia de los micelios extraradicales intactos (MEIs) de HMA nativos en el trigo cultivado en suelo tóxico por Mn, con un enfoque en la distribución específica de tejido y subcelular de Ca, Mg, P y Mn. El trigo cultivado en suelo precolonizado utilizando un MEI intacto asociado mostró un crecimiento mejorado y un aumento en los contenidos de P. Durante la primera semana de crecimiento, las concentraciones de Mn aumentaron en las raíces y brotes del trigo, pero posteriormente el Mn se redujo y se secuestró dentro de la pared celular. En contraste, en ausencia de un MEI intacto, la acumulación de Mn en el trigo siguió un patrón aparente de curso continuo en el tiempo. El secuestro de Mn mediado por HMA parece contribuir a la desintoxicación de Mn al limitar la acumulación excesiva en el citoplasma. Además, los cambios impulsados por HMA en la distribución de elementos sugieren una respuesta dinámica, en la que la absorción de nutrientes en una etapa temprana se transforma en un mecanismo protector a largo plazo. Estos hallazgos destacan el potencial de los HMA para mitigar el estrés por Mn en los cultivos, proporcionando información para estrategias de agricultura sostenible y remediación del suelo.