El arroz es un cultivo crucial para muchas personas en todo el mundo, especialmente en regiones como Asia, América Latina y partes de África. Tailandia es uno de los mayores exportadores de arroz. Hoy en día, los agricultores utilizan productos químicos para controlar las enfermedades del arroz, lo que puede tener efectos negativos en los seres humanos y el medio ambiente. Por lo tanto, el objetivo de este estudio fue examinar las capacidades promotoras de plantas de las cepas fúngicas endofíticas DMKU-R3G3 en invernaderos. La cepa fúngica endofítica DMKU-R3G3, que fue aislada de la raíz de arroz orgánico, se identificó en base a características morfológicas y análisis filogenético. La producción de AIA se detectó utilizando el reactivo de Salkowski. Después de 7 días de incubación, el hallazgo reveló que la cepa cultivada en PDB suplementado con triptófano produjo una mayor concentración de AIA (25,45 g/mL). La inoculación con DMKU-R3G3 mejoró significativamente el crecimiento del arroz, como lo demuestran aumentos notables en la altura del brote, la longitud de la raíz y el peso fresco. Además, el contenido de clorofila de las plantas de arroz también aumentó 1,78 veces más que el grupo de control. Además, el análisis proteómico reveló que el arroz respondió a la colonización de los hongos endofíticos produciendo proteínas sensibles a las auxinas para regular el contenido de AIA en el tejido de la planta e induciendo la producción total de clorofila debido a la regulación al alza de proteínas en la vía de biosíntesis de clorofila. Los resultados obtenidos de este estudio llevan a la conclusión de que la cepa DMKU-R3G3 posee la capacidad de mejorar el crecimiento de las plantas a través de la producción de fitohormonas en condiciones de invernadero. Por lo tanto, el endofito DMKU-R3G3 tiene el potencial de ser un promotor de crecimiento de plantas ecológico prometedor para el cultivo sostenible de arroz.