Las células madre mesenquimales (MSC) son uno de los tipos de células madre más estudiados debido a su capacidad de diferenciación en múltiples linajes, así como a su capacidad de secretar factores regenerativos y modular funciones inmunes. Sin embargo, persisten problemas con respecto a su aplicación adicional para la terapia celular. Aquí, para demostrar la superioridad de la mejora de las MSC, dividimos las MSC derivadas de sangre de cordón umbilical (UCB-MSC) de 15 donantes en dos grupos basados en la eficacia y revelamos variaciones dependientes del donante en el efecto antiinflamatorio de las MSC en los macrófagos, así como en su efecto inmunorregulador en las células T. A través de análisis de marcadores de superficie (242 anticuerpos), encontramos que el HLA-A2 estaba positivamente relacionado con la función antiinflamatoria e inmunorreguladora de las MSC. Además, el silenciamiento del ARN de HLA-A2 en las MSC atenuó sus efectos terapéuticos in vitro; es decir, la supresión de los macrófagos estimulados por LPS y las células T estimuladas por fitohemaglutinina. Además, el silenciamiento de HLA-A2 en las MSC disminuyó significativamente sus efectos terapéuticos en un modelo de rata de daño pulmonar hiperóxico. El presente estudio proporciona nuevas perspectivas sobre el control de calidad de las MSC derivadas de donantes para el tratamiento de condiciones y enfermedades inflamatorias.