En la mayoría de los fotótrofos eucariotas, toda la síntesis de hemo está localizada en el plastidio, y las enzimas de origen cianobacteriano dominan la vía. A pesar de eso, la porfobilinógeno deaminasa (PBGD), la enzima responsable de la síntesis de hidroximetilbilano en el plastidio, muestra una afiliación filogenética a las alfa-proteobacterias, el supuesto ancestro de las mitocondrias. Sorprendentemente, no se encuentra PBGD de tal origen en la vía del hemo de los supuestos socios de la endosimbiosis del plastidio primario, un eucariota principalmente heterótrofo y una cianobacteria. Parece que la PBGD alfa-proteobacteriana está ausente en los glaucófitos, pero está presente en los rodófitos, clorófitos, plantas y la mayoría de las algas con plastidios complejos. Esto puede sugerir que en los fotótrofos eucariotas, excepto en los glaucófitos, o se retuvo el gen del ancestro mitocondrial mientras que se perdieron en la evolución los pseudoparalogs cianobacterianos y eucariotas, o el gen fue adquirido por transferencia de genes no endosimbiótica de una alfa-proteobacteria no especificada y reemplazó funcionalmente a sus contrapartes cianobacterianas y eucariotas.