Los portainjertos son cruciales para la sostenibilidad de la industria de los cítricos a nivel mundial. Los híbridos intergenéricos diploides han contribuido considerablemente a la mejora de los portainjertos de cítricos y sus formas tetraploides (doble diploides) son recursos importantes para la creación de una nueva generación de portainjertos tetraploides. Para optimizar la eficiencia de las estrategias de cría de portainjertos tetraploides, se requiere más conocimiento sobre la herencia en los genitores alotetraploides. Un conjunto de 159 nuevos marcadores SNP que distinguen completamente a (L.) Raf. de las especies fue desarrollado a partir de polimorfismos extraídos de datos de GBS y se utilizó para establecer un mapa genético de citrumelo tetraploide (Macfad.) y para analizar el comportamiento meiótico de citrumelo tetraploide y citrandarín (Blanco). El mapa genético de citrumelo tetraploide fue altamente sinténico y colineal con el genoma de referencia de clementina. La tasa aparente de recombinación intergenérica estaba fuertemente limitada por un alto emparejamiento cromosómico preferencial, lo que resultaba en una herencia intermedia con tendencia disómica. Dicha herencia, también observada en citrandarín tetraploide, resulta en la transmisión por los gametos diploides de una alta tasa de heterocigosidad intergenérica. Por lo tanto, se espera que una gran parte del valor genético seleccionado en el portainjerto intergenérico diploide original se transmita a las progenies sexuales tetraploides.