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Hemibiotrófico Modula la Expresión de Genes SWEET en Papa (L.)

Autores: Kardile, Hemant B.; Karkute, Suhas Gorakh; Challam, Clarissa; Sharma, Nirmal Kant; Shelake, Rahul Mahadev; Kawar, Prashant Govindrao; Patil, Virupaksh U.; Deshmukh, Rupesh; Bhardwaj, Vinay; Chourasia, Kumar Nishant; Valluri, Srikar Duttasai

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2023

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Acceso abierto

Artículo científico
2023

Hemibiotrófico Modula la Expresión de Genes SWEET en Papa (L.)


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Botánica

Palabras clave

Azúcar
Eflujo
Transportadores
Genes
Tizón tardío
Papa

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 24

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
Los transportadores de eflujo de azúcar (SWEET) están involucrados en diversos procesos biológicos de las plantas. Los patógenos los han explotado para obtener beneficios nutricionales y, posteriormente, promover la progresión de la enfermedad. Estudios recientes han implicado la participación de genes de papa en la devastadora enfermedad de la tizón tardío causada por . Aquí, identificamos y designamos 37 genes putativos como en papa. Realizamos un análisis in silico detallado, incluyendo la estructura del gen, dominios conservados y relación filogenética. Se utilizaron datos de RNA-seq disponibles públicamente para recuperar los perfiles de expresión de los genes. Se identificaron los genes SWEET responsables de la respuesta a la tizón tardío a partir de los datos de RNA-seq y luego se validaron utilizando PCR cuantitativa en tiempo real. Se estudió la expresión génica junto con los genes marcadores biotróficos () y necrotróficos () de . Además, exploramos la co-localización de loci de resistencia y genes. Los resultados indicaron que nueve genes transportadores respondieron a la . en papa. Entre estos, seis transportadores, a saber, , 12, 18, 27, 29 y 31, mostraron una mayor expresión después de la inoculación. Curiosamente, los niveles de expresión observados se alinearon con el ciclo de vida de , donde la expresión de estos genes se mantuvo regulada al alza durante la fase biotrófica y disminuyó más tarde. En contraste, , 14 y 32 no mostraron regulación al alza en las muestras inoculadas, lo que sugiere que no fueron blanco de los patógenos. Este estudio subraya estos transportadores como objetivos principales en la tizón tardío de papa, fundamentales en la progresión de la enfermedad y candidatos potenciales para la ingeniería de genotipos de papa resistentes a la tizón.

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