Hemibiotrófico Modula la Expresión de Genes SWEET en Papa (L.)
Autores: Kardile, Hemant B.; Karkute, Suhas Gorakh; Challam, Clarissa; Sharma, Nirmal Kant; Shelake, Rahul Mahadev; Kawar, Prashant Govindrao; Patil, Virupaksh U.; Deshmukh, Rupesh; Bhardwaj, Vinay; Chourasia, Kumar Nishant; Valluri, Srikar Duttasai
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Hemibiotrófico Modula la Expresión de Genes SWEET en Papa (L.)
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Azúcar
Eflujo
Transportadores
Genes
Tizón tardío
Papa
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 24
Citaciones: Sin citaciones
Los transportadores de eflujo de azúcar (SWEET) están involucrados en diversos procesos biológicos de las plantas. Los patógenos los han explotado para obtener beneficios nutricionales y, posteriormente, promover la progresión de la enfermedad. Estudios recientes han implicado la participación de genes de papa en la devastadora enfermedad de la tizón tardío causada por . Aquí, identificamos y designamos 37 genes putativos como en papa. Realizamos un análisis in silico detallado, incluyendo la estructura del gen, dominios conservados y relación filogenética. Se utilizaron datos de RNA-seq disponibles públicamente para recuperar los perfiles de expresión de los genes. Se identificaron los genes SWEET responsables de la respuesta a la tizón tardío a partir de los datos de RNA-seq y luego se validaron utilizando PCR cuantitativa en tiempo real. Se estudió la expresión génica junto con los genes marcadores biotróficos () y necrotróficos () de . Además, exploramos la co-localización de loci de resistencia y genes. Los resultados indicaron que nueve genes transportadores respondieron a la . en papa. Entre estos, seis transportadores, a saber, , 12, 18, 27, 29 y 31, mostraron una mayor expresión después de la inoculación. Curiosamente, los niveles de expresión observados se alinearon con el ciclo de vida de , donde la expresión de estos genes se mantuvo regulada al alza durante la fase biotrófica y disminuyó más tarde. En contraste, , 14 y 32 no mostraron regulación al alza en las muestras inoculadas, lo que sugiere que no fueron blanco de los patógenos. Este estudio subraya estos transportadores como objetivos principales en la tizón tardío de papa, fundamentales en la progresión de la enfermedad y candidatos potenciales para la ingeniería de genotipos de papa resistentes a la tizón.
Descripción
Los transportadores de eflujo de azúcar (SWEET) están involucrados en diversos procesos biológicos de las plantas. Los patógenos los han explotado para obtener beneficios nutricionales y, posteriormente, promover la progresión de la enfermedad. Estudios recientes han implicado la participación de genes de papa en la devastadora enfermedad de la tizón tardío causada por . Aquí, identificamos y designamos 37 genes putativos como en papa. Realizamos un análisis in silico detallado, incluyendo la estructura del gen, dominios conservados y relación filogenética. Se utilizaron datos de RNA-seq disponibles públicamente para recuperar los perfiles de expresión de los genes. Se identificaron los genes SWEET responsables de la respuesta a la tizón tardío a partir de los datos de RNA-seq y luego se validaron utilizando PCR cuantitativa en tiempo real. Se estudió la expresión génica junto con los genes marcadores biotróficos () y necrotróficos () de . Además, exploramos la co-localización de loci de resistencia y genes. Los resultados indicaron que nueve genes transportadores respondieron a la . en papa. Entre estos, seis transportadores, a saber, , 12, 18, 27, 29 y 31, mostraron una mayor expresión después de la inoculación. Curiosamente, los niveles de expresión observados se alinearon con el ciclo de vida de , donde la expresión de estos genes se mantuvo regulada al alza durante la fase biotrófica y disminuyó más tarde. En contraste, , 14 y 32 no mostraron regulación al alza en las muestras inoculadas, lo que sugiere que no fueron blanco de los patógenos. Este estudio subraya estos transportadores como objetivos principales en la tizón tardío de papa, fundamentales en la progresión de la enfermedad y candidatos potenciales para la ingeniería de genotipos de papa resistentes a la tizón.