Los objetivos del presente estudio fueron los siguientes: (a) describir la prevalencia de hallazgos irregulares en los pezones en salas de ordeño con ovejas lecheras y cabras después de que se completaran los procedimientos de limpieza post-ordeño, (b) asociar el aislamiento de estafilococos de los pezones con la presencia de hallazgos irregulares y (c) identificar predictores de la presencia de hallazgos irregulares en los pezones. Los pezones en la sala de ordeño de 255 granjas de ovejas y 66 de cabras fueron evaluados macroscópicamente para detectar la presencia de hallazgos irregulares inmediatamente después de completar la limpieza de la sala. En total, se evaluaron 1115 y 303 pezones, respectivamente. Una entrevista detallada con el agricultor sirvió para registrar las características de la sala de ordeño y obtener información sobre las variables de manejo y salud en la granja. Se observaron pezones con hallazgos irregulares evidentes macroscópicamente en 150 salas de ordeño (46.7%). En general, se encontraron 593 pezones (41.8%) con hallazgos irregulares evidentes macroscópicamente. Se registraron suciedad, residuos de leche y grietas o desgarros en los pezones del 90.0%, 36.0% y 12.7% de las salas con hallazgos irregulares. Los estafilococos se aislaron con más frecuencia de los pezones con hallazgos irregulares que de los que no estaban dañados: del 37.4% (222/593) frente al 12.8% (106/825). Se aislaron con más frecuencia de los pezones con residuos de leche (39.4%) y de los pezones con suciedad (39.0%). A través de un análisis multivariable, surgieron las siguientes tres variables como predictores significativos de la presencia de pezones con hallazgos irregulares: el número diario de sesiones de ordeño, el mes del período de lactancia en el momento de la muestra y el número de unidades de ordeño disponibles por posición animal. El estudio proporciona, por primera vez a nivel internacional, una evaluación de la frecuencia de pezones problemáticos en las salas de ordeño de granjas de rumiantes pequeños. El análisis de los predictores ha proporcionado un enfoque para aspectos específicos de manejo, donde se necesitan realizar intervenciones, con el fin de mejorar la situación en las granjas con problemas. La consecuente carga estafilocócica aumentada en los pezones con hallazgos irregulares apunta al aumento del riesgo de infecciones intramamarias en tales casos.