La relación entre la condición corporal de diferentes especies de mamíferos pequeños y el hábitat que ocupan está poco analizada. Analizamos el índice de condición corporal, BCI, de 18 especies de mamíferos pequeños atrapados en hábitats forestales, de arbustos, humedales, praderas, ribereños, mixtos y fragmentados, perturbados, agrícolas y comensales en Lituania durante el período de 1980-2023. La composición de las comunidades de mamíferos pequeños dependía del hábitat, siendo más rica en praderas, con dieciocho especies, y más pobre en hábitats ribereños, con nueve especies. Se observó una variación significativa en el BCI con respecto al hábitat en ocho especies de mamíferos pequeños (Sorex araneus, S. minutus, Apodemus agrarius, A. flavicollis, Clethrionomys glareolus, Alexandromys oeconomus, Microtus agrestis y M. arvalis). El BCI promedio más alto para la mayoría de estas especies se encontró en hábitats perturbados, siendo S. minutus y M. arvalis los que mostraron el BCI más alto en hábitats agrícolas. El BCI promedio más bajo para la mayoría de las especies se encontró en hábitats mixtos, mientras que C. glareolus y M. arvalis exhibieron el BCI más bajo en hábitats de arbustos. En general, las especies que dominan ciertos hábitats no tenían el BCI más alto. Este es el primer estudio multi-especies y multi-hábitat sobre la condición corporal en mamíferos pequeños en latitudes medias.