Evaluar las empresas farmacéuticas con capacidad de desarrollo sostenible y de alta calidad (SHQDA) no solo puede proporcionar estrategias para el departamento de gestión farmacéutica en la formulación de planes de desarrollo empresarial, sino también ofrecer sugerencias y orientación para que las empresas mejoren su competitividad central. Sin embargo, la investigación previa presenta varias deficiencias al abordar la evaluación de empresas con SHQDA en entornos inciertos para predecir el comportamiento psicológico del evaluador y la correlación entre los criterios de evaluación. Para superar los defectos mencionados, proponemos un marco integrado para calificar empresas farmacéuticas que incorpora la teoría del arrepentimiento, alternativas de medición y clasificación basada en la solución de compromiso (MARCOS) y la media heroniana operando dentro de un conjunto neutrosófico de valor único (SVNS). Primero, se emplea el número neutrosófico de valor único (SVNN) para retratar la información de evaluación de los expertos. Luego, se presenta una nueva función de puntuación neutrosófica de valor único para mejorar la racionalidad de la comparación del SVNN. A continuación, se construye un modelo combinado de peso de criterios mediante la síntesis del mejor y peor método (BWM) y la importancia de los criterios a través del enfoque de correlación intercriterial (CRITIC) para obtener información de peso más razonable y creíble. Además, se propone el marco de evaluación integrado que combina la teoría del arrepentimiento, el método MARCOS y el operador de media heroniana para evaluar y seleccionar las empresas con SHQDA en un entorno neutrosófico de valor único. Finalmente, se presenta un estudio empírico sobre la evaluación de empresas farmacéuticas dentro de SVNS para ilustrar la utilidad y efectividad del método de teoría del arrepentimiento SVNS-MARCOS presentado. Posteriormente, se implementan análisis de sensibilidad y análisis comparativos para proporcionar evidencia de la racionalidad y superioridad del método propuesto.