Los brotes de soja constituyen un segmento significativo del mercado de verduras debido a su riqueza nutricional, particularmente en varios flavonoides, que contribuyen a numerosos beneficios para la salud. El aumento del contenido de flavonoides en los brotes de soja es fundamental para mejorar su valor económico. Si bien la investigación ha establecido el potencial de la luz azul para promover la síntesis de antocianinas, una subclase de flavonoides conocida por sus ventajas para la salud, los mecanismos regulatorios precisos siguen siendo elusivos. En este estudio, identificamos una notable regulación positiva de un factor de transcripción tipo MYB R2R3, GmMYB114, en respuesta a la exposición a la luz azul, exhibiendo una correlación positiva significativa con la acumulación de antocianinas en los brotes de soja. El papel funcional de GmMYB114 fue validado en raíces peludas de soja, donde su sobreexpresión aumentó sustancialmente la síntesis de antocianinas. Investigaciones adicionales utilizando ensayos de levadura de un híbrido (Y1H), reportero de luciferasa dual (LUC) y GUS revelaron que GmMYB114 influye indirectamente en la síntesis de antocianinas, ya que no se une directamente a los promotores de los genes de síntesis de antocianinas para activar su expresión. Estos hallazgos contribuyen a esclarecer el mecanismo subyacente a la mejora de la síntesis de antocianinas mediada por la luz azul en los brotes de soja, ofreciendo valiosos conocimientos para aprovechar tecnologías moleculares para obtener brotes de soja enriquecidos en antocianinas.