La gestión de cuencas en Indonesia continúa enfrentando diversos problemas causados por desastres naturales, particularmente desastres hidrometeorológicos, que se ven agravados por los efectos del cambio climático. Coordinar y sincronizar los intereses de muchas partes en la gestión de cuencas con diversos escenarios de condiciones naturales es un gran desafío en la creación de una cuenca saludable y productiva. Se han llevado a cabo múltiples iniciativas, desde el establecimiento de reglas y políticas hasta su implementación y evaluación de los efectos, lo que ha llevado a aprender diversas lecciones para una mejor gestión. Este artículo presenta un estudio sobre la gestión de cuencas en Indonesia y recomienda mejoras alternativas hacia una gestión de cuencas saludable y productiva. Se utiliza una combinación de un análisis cualitativo descriptivo de la experiencia de los autores en diversas actividades de investigación y un análisis crítico para examinar las condiciones existentes y formular recomendaciones para una mejor gestión sostenible hacia una cuenca saludable y productiva. La mayoría de las cuencas indonesias son susceptibles a la degradación debido a numerosas amenazas. Los desafíos en la gestión de cuencas en Indonesia, incluyendo la degradación de la tierra y desastres inducidos por el clima, la falta de sincronización y coordinación, recursos limitados y factores antropogénicos, han llevado a una disminución de la salud y productividad de las cuencas y han obstaculizado una gestión efectiva. La gestión integrada, especialmente a nivel de microcuenca, aborda estos desafíos. Una gestión integrada de cuencas exitosa requiere la participación de la comunidad, acciones de gestión adecuadas para ubicaciones específicas, apoyo tecnológico, alineación regulatoria y colaboración de las partes interesadas para garantizar una cuenca saludable, productiva y sostenible para las generaciones presentes y futuras.