El olivo (subespecie var.) representa el cultivo fundamental de la agricultura de Apulia, que se basa en la producción de aceite y aceitunas de mesa. La alta variabilidad genética del germoplasma de olivo apuliano está en riesgo de erosión genética debido a cambios sociales, económicos y climáticos. Además, desde 2013, la propagación de la bacteria Gram-negativa subespecie responsable del síndrome de declive rápido del olivo (OQDS) ha estado amenazando la biodiversidad del olivo en Apulia, dañando la economía regional y el patrimonio paisajístico. El objetivo de este estudio fue investigar la respuesta diferencial a la infección en una colección de 100 genotipos de olivo autóctonos apulianos, que incluyen variedades menores, genotipos F1 y cultivares de referencia. Fueron genotipados utilizando 10 marcadores SSR y cultivados durante 5 años en un campo experimental; luego, fueron inoculados con la bacteria. Se realizaron evaluaciones de síntomas y la cuantificación de la bacteria utilizando un ensayo de qPCR y unidades formadoras de colonias (UFC) tres y cinco años después de la inoculación. El estudio permitió la identificación de nueve genotipos supuestamente resistentes que representan un primer panel de recursos de germoplasma de olivo útiles tanto para estudiar los mecanismos de respuesta al patógeno como para ser una reserva para replantar en áreas infectadas.