La acumulación de altos niveles de cadmio (Cd) en los granos de cacao genera varios problemas comerciales y de salud. Hipotetizamos que la diversidad fenotípica y genotípica del cacao podría proporcionar nuevas ideas para disminuir la acumulación de Cd en los granos de cacao. Se evaluaron nueve genotipos de portainjertos de cacao durante un período de hasta 90 días bajo exposiciones de 0, 6 y 12 (mg·kg) de CdCl, y se midieron el contenido de Cd y la dinámica de crecimiento de las plantas en hojas, tallos y raíces. Los datos revelaron que todos los genotipos de cacao estudiados aquí eran altamente tolerantes al Cd, ya que presentaron un índice de tolerancia >= 60%. En los brotes, EET61 y PA46 presentaron la mayor (~270 mg·kg DW) y la menor (~20 mg·kg DW) concentración de Cd, respectivamente. En consecuencia, solo el EET61 mostró un aumento en el factor de translocación de cadmio en los brotes durante los 90 días de exposición. Sin embargo, al analizar la asignación de cadmio a diferentes órganos en función de la producción total de masa seca de la planta, ninguno de los genotipos mantuvo una alta compartimentalización de Cd en las raíces, ya que P46, que fue el genotipo con la mayor asignación de Cd a las raíces, presentó solo el 20% del cadmio total por planta en este órgano y el 80% asignado a los brotes, bajo Cd 12 (mg·kg) y después de 90 días de exposición. Así, la variabilidad genotípica/fenotípica en los portainjertos de cacao puede proporcionar estrategias valiosas para maximizar la reducción del contenido de Cd en los brotes. En este sentido, IMC67 y PA46 fueron los que se destacaron en el presente estudio.