La implementación de nuevos sistemas de plantación en huertos de almendros (Prunus dulcis (L.) Batsch, sin (Mill.)) para prácticas más sostenibles ha hecho que la arquitectura del árbol sea cada vez más relevante como un rasgo de selección importante en la cría de plantas. Múltiples características definen la estructura tridimensional del árbol, siendo la producción de brotes la más importante. Los brotes pueden desarrollarse después de un período de descanso (brotes prolepticos) o inmediatamente (brotes silepticos), al mismo tiempo que se extiende el brote padre. Las interacciones entre el patrón y el portainjerto pueden cambiar la proporción de brotes prolepticos y silepticos y, por lo tanto, alterar la arquitectura del árbol. Para estudiar este efecto, analizamos la formación de brotes en tres cultivares de patrón de almendro injertados en cinco portainjertos híbridos interespecíficos. Se recopilaron el tipo de brote (proleptico o sileptico) y el número de entrenudos por brote en ramas de dos años en árboles de tres años sin podar. Encontramos que los genotipos de portainjerto pueden alterar el patrón de producción de brotes, especialmente el número de brotes silepticos formados. Se necesita más información sobre la respuesta molecular para comprender los procesos biológicos detrás de estos fenotipos diferenciales, que parecen ser modulados tanto por la dominancia apical como por el control apical.