Los nematodos del suelo se consideran indicadores de la calidad del suelo debido a sus respuestas inmediatas a los cambios en el ambiente del suelo y las plantas. Sin embargo, se sabe poco sobre los efectos de los genotipos de las plantas en la comunidad de nematodos del suelo. Para elucidar esto, se realizó un análisis de secuenciación de alto rendimiento y cromatografía de gases/espectrometría de masas para analizar la comunidad de nematodos del suelo y la estructura de los exudados radiculares en la rizosfera de tomates con diferentes resistencias. El grupo dominante de nematodos del suelo en el suelo de tomates resistentes fue, mientras que el grupo de nematodos del suelo en la rizosfera de los tomates susceptibles y tolerantes fue. El análisis de agrupamiento jerárquico y la escalación multidimensional no métrica mostraron que las tres comunidades de nematodos del suelo se agruparon en tres grupos según el nivel de resistencia de los cultivares de tomate. La comunidad de nematodos del suelo de los tomates resistentes tenía un índice de madurez más alto y un índice de planta-parásito bajo, índice de Wasilewska e índice de enfermedad en comparación con los valores de los tomates susceptibles y tolerantes. El análisis de redundancia reveló que el índice de enfermedad y los exudados radiculares estaban fuertemente relacionados con la comunidad de nematodos del suelo de los tres cultivares de tomate. En conjunto, la resistencia de los cultivares de tomate y los exudados radiculares dan forma conjuntamente a la comunidad de nematodos del suelo. Este estudio proporcionó una valiosa contribución para entender el mecanismo por el cual los genotipos de las plantas dan forma a la comunidad de nematodos del suelo.