Estrategia de Genotipado por Secuenciación para Integrar la Estructura Genómica, Diversidad y Rendimiento de Variadas Razas de Codorniz Japonesa ()
Autores: Volkova, Natalia A.; Romanov, Michael N.; Abdelmanova, Alexandra S.; Larionova, Polina V.; German, Nadezhda Yu.; Vetokh, Anastasia N.; Shakhin, Alexey V.; Volkova, Ludmila A.; Anshakov, Dmitry V.; Fisinin, Vladimir I.; Narushin, Valeriy G.; Griffin, Darren K.; Sölkner, Johann; Brem, Gottfried; McEwan, John C.; Brauning, Rudiger; Zinovieva, Natalia A.
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Estrategia de Genotipado por Secuenciación para Integrar la Estructura Genómica, Diversidad y Rendimiento de Variadas Razas de Codorniz Japonesa ()
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
Huellas
Selección artificial
Genomas
Aves domesticadas
Marcadores SNP
Regiones genómicas
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
Se pueden detectar rastros de selección artificial a largo plazo en los genomas de aves domesticadas a través de un análisis de todo el genoma utilizando marcadores de polimorfismo de un solo nucleótido (SNP). Este estudio examinó, por lo tanto, regiones genómicas putativas bajo selección que son relevantes para la historia de desarrollo, divergencia y filogenia entre codornices japonesas de varias razas y tipos de utilidad. Muestreamos 99 aves de ocho razas (11% del acervo genético global) de tipos de huevo (japonesa, blanca inglesa, negra inglesa, esmoquin y dorada manchuriana), carne (blanca de Texas y faraón) y de doble propósito (estonia). El análisis de genotipado por secuenciación se realizó por primera vez en codornices domésticas, proporcionando 62,935 SNPs. Utilizando análisis de componentes principales, Neighbor-Net y algoritmos de Admixture, las razas estudiadas se caracterizaron según su arquitectura genómica, ascendencia y dirección de la cría selectiva. Las razas japonesa y faraón tuvieron el menor número y longitud de segmentos homocigotos, lo que indica una menor presión selectiva. Las razas esmoquin y blanca de Texas mostraron los valores más altos de estos indicadores y endogamia genómica, sugiriendo una mayor homocigosidad. Revelamos evidencia de la integración de datos genómicos y de rendimiento, y nuestros hallazgos son aplicables para esclarecer la historia de creación y variabilidad genómica en razas de codorniz que, a su vez, serán útiles para futuras estrategias de mejora en la cría.
Descripción
Se pueden detectar rastros de selección artificial a largo plazo en los genomas de aves domesticadas a través de un análisis de todo el genoma utilizando marcadores de polimorfismo de un solo nucleótido (SNP). Este estudio examinó, por lo tanto, regiones genómicas putativas bajo selección que son relevantes para la historia de desarrollo, divergencia y filogenia entre codornices japonesas de varias razas y tipos de utilidad. Muestreamos 99 aves de ocho razas (11% del acervo genético global) de tipos de huevo (japonesa, blanca inglesa, negra inglesa, esmoquin y dorada manchuriana), carne (blanca de Texas y faraón) y de doble propósito (estonia). El análisis de genotipado por secuenciación se realizó por primera vez en codornices domésticas, proporcionando 62,935 SNPs. Utilizando análisis de componentes principales, Neighbor-Net y algoritmos de Admixture, las razas estudiadas se caracterizaron según su arquitectura genómica, ascendencia y dirección de la cría selectiva. Las razas japonesa y faraón tuvieron el menor número y longitud de segmentos homocigotos, lo que indica una menor presión selectiva. Las razas esmoquin y blanca de Texas mostraron los valores más altos de estos indicadores y endogamia genómica, sugiriendo una mayor homocigosidad. Revelamos evidencia de la integración de datos genómicos y de rendimiento, y nuestros hallazgos son aplicables para esclarecer la historia de creación y variabilidad genómica en razas de codorniz que, a su vez, serán útiles para futuras estrategias de mejora en la cría.