El óxido de la franja del trigo, causado por f. sp. (), representa una amenaza significativa para la producción de trigo en China. Estudios epidémicos previos han demostrado el potencial de alta diversidad genética en las regiones suroeste de China. Entre esta región epidémica, la región oriental del Xizang (Tíbet) tiene una importancia particular, ya que tanto los cultivos de trigo como de cebada son susceptibles a . Sin embargo, existe información limitada sobre el nivel de diversidad genética poblacional, el modelo de reproducción y los patrones de migración del óxido en el este del Xizang. El presente estudio busca abordar esta brecha analizando 146 aislados recolectados de las regiones de Basu, Zuogong y Mangkang, genotipando mediante el 20K Target Gene Array (Genobait). Nuestros resultados mostraron una diversidad genotípica relativamente baja en la región de Basu, mientras que la mayor diversidad genética se observó en el área de Mangkang. El análisis estructural reveló la abundancia de grupos mezclados en Mangkang, que exhibieron que esta población ocurrió debido a la recombinación sexual entre dos grupos ancestrales diferentes. Se observó flujo genético entre las poblaciones de Zuogong y Basu, pero casi no ocurrió entre las poblaciones de Mangkang y Zuogong/Basu. Esta región es el área epidémica de mayor altitud del mundo, facilitando así la evolución del óxido y poseyendo el potencial de transmitir razas recién evolucionadas a regiones de cultivo de trigo de menor altitud. Implementar estrategias de manejo de enfermedades en esta área es de potencial importancia para prevenir la transmisión de razas a otras partes del Xizang, incluso a regiones vecinas posiblemente. Este estudio facilita nuestra comprensión del conocimiento epidemiológico y genético poblacional y la evolución de en Xizang.