El coco es una especie de palma de importancia económica con una larga historia de uso humano. Tiene aplicaciones en varios productos alimenticios, nutracéuticos y cosméticos, y ha habido un renovado interés en el coco en los últimos años debido a sus propiedades nutricionales y medicinales únicas. Desafortunadamente, el crecimiento sostenible de la industria del coco se ha visto obstaculizado por la escasez de plántulas de buena calidad. La mejora genética a través del enfoque de cría tradicional enfrentó considerables obstáculos debido a su naturaleza perenne, su prolongado período juvenil y su alta heterocigosidad. Las herramientas biotecnológicas moleculares, incluidos los marcadores moleculares y la secuenciación de nueva generación (NGS), podrían acelerar los esfuerzos de mejora genética en el coco. Los investigadores han empleado varios marcadores moleculares para revelar la diversidad genética entre las poblaciones de coco y para la construcción de un mapa genético para su explotación en programas de cría de coco en todo el mundo. La secuenciación del genoma completo y la transcriptómica de las diferentes variedades han generado una gran cantidad de datos de secuencia accesibles públicamente, mejorando sustancialmente la capacidad de analizar y comprender los mecanismos moleculares que afectan el rendimiento de los cultivos. La producción de cocos de alto rendimiento y resistentes a enfermedades y la desciframiento de la compleja estructura del genoma del coco pueden beneficiarse enormemente de estas tecnologías. Este artículo tiene como objetivo proporcionar una revisión integral del progreso de la investigación sobre el coco, utilizando iniciativas de genómica, transcriptómica y marcadores moleculares.