Identificación a Nivel Genómico y Análisis Evolutivo de la Familia de Factores de Transcripción GATA en Legumbres Fijadoras de Nitrógeno
Autores: Xia, Meng; Tang, Liwen; Zhai, Haoming; Liu, Yezhou; Zhang, Liangsheng; Chen, Dan
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
2025
Identificación a Nivel Genómico y Análisis Evolutivo de la Familia de Factores de Transcripción GATA en Legumbres Fijadoras de Nitrógeno
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Factores de transcripción
Evolución de las plantas
Simbiosis de nódulos radicales
Genes GATA
Análisis filogenéticos
Especies de leguminosas
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 10
Citaciones: Sin citaciones
Los factores de transcripción GATA son cruciales para el desarrollo de las plantas y las respuestas ambientales, sin embargo, sus roles en la evolución de las plantas y la simbiosis de nódulos radiculares aún no se comprenden bien. Este estudio identificó genes GATA en los genomas de 77 especies de plantas representativas, revelando que esta familia de genes se originó en Charophyta y se expandió significativamente tanto en gimnospermas como en angiospermas. Los análisis filogenéticos, junto con exámenes de motivos conservados y elementos cis-regulatorios, demostraron claramente la divergencia estructural y funcional dentro de la familia GATA. El mapeo cromosómico y el análisis de sinonimia indicaron que la expansión de los genes GATA en la soja resultó principalmente de eventos de duplicación del genoma completo. Estos genes también exhiben alta conservación y signos de selección purificadora. Además, al integrar datos filogenéticos y transcriptómicos de ocho especies de leguminosas fijadoras de nitrógeno, se identificaron varios genes GATA como fuertemente coexpresados, sugiriendo sus posibles roles co-regulatorios en el desarrollo de nódulos y la simbiosis. En conjunto, este estudio ofrece una visión general completa de la dinámica evolutiva de la familia de genes GATA y destaca su posible participación en la simbiosis de nódulos radiculares en leguminosas, proporcionando así una base teórica para futuros estudios mecanicistas.
Descripción
Los factores de transcripción GATA son cruciales para el desarrollo de las plantas y las respuestas ambientales, sin embargo, sus roles en la evolución de las plantas y la simbiosis de nódulos radiculares aún no se comprenden bien. Este estudio identificó genes GATA en los genomas de 77 especies de plantas representativas, revelando que esta familia de genes se originó en Charophyta y se expandió significativamente tanto en gimnospermas como en angiospermas. Los análisis filogenéticos, junto con exámenes de motivos conservados y elementos cis-regulatorios, demostraron claramente la divergencia estructural y funcional dentro de la familia GATA. El mapeo cromosómico y el análisis de sinonimia indicaron que la expansión de los genes GATA en la soja resultó principalmente de eventos de duplicación del genoma completo. Estos genes también exhiben alta conservación y signos de selección purificadora. Además, al integrar datos filogenéticos y transcriptómicos de ocho especies de leguminosas fijadoras de nitrógeno, se identificaron varios genes GATA como fuertemente coexpresados, sugiriendo sus posibles roles co-regulatorios en el desarrollo de nódulos y la simbiosis. En conjunto, este estudio ofrece una visión general completa de la dinámica evolutiva de la familia de genes GATA y destaca su posible participación en la simbiosis de nódulos radiculares en leguminosas, proporcionando así una base teórica para futuros estudios mecanicistas.