Desarrollo a Nivel Genómico de Marcadores Microsatélites Polimórficos y Análisis de Diversidad Genética para el Halófito (Amaranthaceae)
Autores: Xu, Wei; Wang, Jiancheng; Tian, Changyan; Shi, Wei; Wang, Lei
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Desarrollo a Nivel Genómico de Marcadores Microsatélites Polimórficos y Análisis de Diversidad Genética para el Halófito (Amaranthaceae)
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Halófitas anuales
Diversidad genética
Marcadores de microsatélites
Desiertos salinos
Cría de tolerancia a la sal
Estudios genéticos
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
, que es una halófita anual, crece en desiertos salinos en Asia Central con un potencial uso en la recuperación de suelos salinos y en la cría de tolerancia a la sal. Estudiar su diversidad genética es fundamental para programas de conservación y cría efectivos. En este estudio, nuestro objetivo fue desarrollar un conjunto de marcadores microsatélites polimórficos para analizar la diversidad genética de . Identificamos 177,805 SSRs del genoma, con una longitud promedio de 19.49 pb, que estaban presentes a una densidad de 393.37 SSR/Mb. Los repeticiones de trinucleótidos dominaron (75.74%) diferentes tipos de motivos, y el motivo principal fue CAA/TTG (44.25%). Desarrollamos con éxito 38 marcadores SSR que exhibieron un polimorfismo sustancial, mostrando un promedio de 6.18 alelos con un valor promedio de contenido de información de polimorfismo (PIC) de 0.516. Los marcadores se utilizaron para evaluar la diversidad genética de 52 individuos recolectados de tres poblaciones de en Xinjiang, China. Los resultados mostraron que la diversidad genética fue moderada a alta, con una heterocigosidad esperada media (He) de 0.614, un índice de información de Shannon medio (I) de 1.23, y un índice de diferenciación genética medio (Fst) de 0.263. Los marcadores SSR desarrollados en este estudio proporcionan un recurso valioso para futuros estudios genéticos y programas de cría de , e incluso de otras especies en .
Descripción
, que es una halófita anual, crece en desiertos salinos en Asia Central con un potencial uso en la recuperación de suelos salinos y en la cría de tolerancia a la sal. Estudiar su diversidad genética es fundamental para programas de conservación y cría efectivos. En este estudio, nuestro objetivo fue desarrollar un conjunto de marcadores microsatélites polimórficos para analizar la diversidad genética de . Identificamos 177,805 SSRs del genoma, con una longitud promedio de 19.49 pb, que estaban presentes a una densidad de 393.37 SSR/Mb. Los repeticiones de trinucleótidos dominaron (75.74%) diferentes tipos de motivos, y el motivo principal fue CAA/TTG (44.25%). Desarrollamos con éxito 38 marcadores SSR que exhibieron un polimorfismo sustancial, mostrando un promedio de 6.18 alelos con un valor promedio de contenido de información de polimorfismo (PIC) de 0.516. Los marcadores se utilizaron para evaluar la diversidad genética de 52 individuos recolectados de tres poblaciones de en Xinjiang, China. Los resultados mostraron que la diversidad genética fue moderada a alta, con una heterocigosidad esperada media (He) de 0.614, un índice de información de Shannon medio (I) de 1.23, y un índice de diferenciación genética medio (Fst) de 0.263. Los marcadores SSR desarrollados en este estudio proporcionan un recurso valioso para futuros estudios genéticos y programas de cría de , e incluso de otras especies en .