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Desarrollo a Nivel Genómico de Marcadores Microsatélites Polimórficos y Análisis de Diversidad Genética para el Halófito (Amaranthaceae)

Autores: Xu, Wei; Wang, Jiancheng; Tian, Changyan; Shi, Wei; Wang, Lei

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2023

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Acceso abierto

Artículo científico
2023

Desarrollo a Nivel Genómico de Marcadores Microsatélites Polimórficos y Análisis de Diversidad Genética para el Halófito (Amaranthaceae)


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Botánica

Palabras clave

Halófitas anuales
Diversidad genética
Marcadores de microsatélites
Desiertos salinos
Cría de tolerancia a la sal
Estudios genéticos

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 8

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
, que es una halófita anual, crece en desiertos salinos en Asia Central con un potencial uso en la recuperación de suelos salinos y en la cría de tolerancia a la sal. Estudiar su diversidad genética es fundamental para programas de conservación y cría efectivos. En este estudio, nuestro objetivo fue desarrollar un conjunto de marcadores microsatélites polimórficos para analizar la diversidad genética de . Identificamos 177,805 SSRs del genoma, con una longitud promedio de 19.49 pb, que estaban presentes a una densidad de 393.37 SSR/Mb. Los repeticiones de trinucleótidos dominaron (75.74%) diferentes tipos de motivos, y el motivo principal fue CAA/TTG (44.25%). Desarrollamos con éxito 38 marcadores SSR que exhibieron un polimorfismo sustancial, mostrando un promedio de 6.18 alelos con un valor promedio de contenido de información de polimorfismo (PIC) de 0.516. Los marcadores se utilizaron para evaluar la diversidad genética de 52 individuos recolectados de tres poblaciones de en Xinjiang, China. Los resultados mostraron que la diversidad genética fue moderada a alta, con una heterocigosidad esperada media (He) de 0.614, un índice de información de Shannon medio (I) de 1.23, y un índice de diferenciación genética medio (Fst) de 0.263. Los marcadores SSR desarrollados en este estudio proporcionan un recurso valioso para futuros estudios genéticos y programas de cría de , e incluso de otras especies en .

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