Estudio de Genómica Poblacional y Implicaciones para la Conservación Basado en Genotipado por Secuenciación
Autores: Kang, Halam; An, Sung-Mo; Park, Yoo-Jung; Lee, Yoo-Bin; Lee, Jung-Hyun; Cheon, Kyeong-Sik; Kim, Kyung-Ah
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2022
Acceso abierto
Artículo científico
2022
Estudio de Genómica Poblacional y Implicaciones para la Conservación Basado en Genotipado por Secuenciación
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Endémico
Arbusto
Diversidad genética
Conservación
Estructura poblacional
SNP
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 12
Citaciones: Sin citaciones
(Nakai) Hisauti y H. Hara es un arbusto perenne endémico de la República de Corea que crece de forma natural solo en una región muy limitada de las áreas de dolomita de las provincias de Gangwon-do y Chungcheongbuk-do en la República de Corea. Dadas sus características geográficas, es más vulnerable que las especies más ampliamente distribuidas. A pesar de la necesidad de información integral para apoyar la conservación, la información genética poblacional para esta especie es muy escasa. En este estudio, analizamos la diversidad genética y la estructura poblacional de 94 individuos de seis poblaciones utilizando un enfoque de genotipado por secuenciación (GBS) para proporcionar información importante para una adecuada conservación y gestión. Nuestros resultados, basados en 3088 polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs), mostraron una heterocigosidad esperada media () de 0.233, sin signos de endogamia dentro de la población ( que estuvo cerca o incluso por debajo de cero en todas las poblaciones), y un alto nivel de diferenciación genética ( = 0.170). El análisis de varianza molecular (AMOVA) indicó que la principal varianza molecular existía dentro de las poblaciones (84.5%) en lugar de entre poblaciones (17.0%). Sugerimos que se propusieron seis unidades de gestión para la conservación considerando el análisis de estructura bayesiana y el análisis filogenético, y dado las diversas situaciones actuales que enfrenta , se cree que no solo se debe considerar la conservación in situ, sino también la conservación ex situ.
Descripción
(Nakai) Hisauti y H. Hara es un arbusto perenne endémico de la República de Corea que crece de forma natural solo en una región muy limitada de las áreas de dolomita de las provincias de Gangwon-do y Chungcheongbuk-do en la República de Corea. Dadas sus características geográficas, es más vulnerable que las especies más ampliamente distribuidas. A pesar de la necesidad de información integral para apoyar la conservación, la información genética poblacional para esta especie es muy escasa. En este estudio, analizamos la diversidad genética y la estructura poblacional de 94 individuos de seis poblaciones utilizando un enfoque de genotipado por secuenciación (GBS) para proporcionar información importante para una adecuada conservación y gestión. Nuestros resultados, basados en 3088 polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs), mostraron una heterocigosidad esperada media () de 0.233, sin signos de endogamia dentro de la población ( que estuvo cerca o incluso por debajo de cero en todas las poblaciones), y un alto nivel de diferenciación genética ( = 0.170). El análisis de varianza molecular (AMOVA) indicó que la principal varianza molecular existía dentro de las poblaciones (84.5%) en lugar de entre poblaciones (17.0%). Sugerimos que se propusieron seis unidades de gestión para la conservación considerando el análisis de estructura bayesiana y el análisis filogenético, y dado las diversas situaciones actuales que enfrenta , se cree que no solo se debe considerar la conservación in situ, sino también la conservación ex situ.