Genómica, origen y señales de selección del ganado Loudi en el centro de Hunan
Autores: Jin, Liangliang; Zhang, Baizhong; Luo, Jing; Li, Jianbo; Liang, Juyong; Wu, Wanghe; Xie, Yongzhong; Li, Fuqiang; Lei, Chuzhao; Yi, Kangle
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2022
Acceso abierto
Artículo científico
2022
Genómica, origen y señales de selección del ganado Loudi en el centro de Hunan
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Xixangxi
Ganado loudi
Diversidad genética
Adaptación ambiental
Conservación de poblaciones
Cría asociada al genoma
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 23
Citaciones: Sin citaciones
Debido a la variabilidad geográfica, cultural y ambiental en Xiangxi, China, se han formado poblaciones de ganado indígena distintivas. Entre ellas, el ganado de Loudi y el ganado de Xiangxi son las razas locales en Hunan, y el entorno en Loudi es relativamente más cerrado y húmedo que en Xiangxi. Para estudiar el genoma y el origen del ganado de Loudi en ambientes cálidos y húmedos, se recolectaron y secuenciaron 29 individuos mediante resecuenciación de genoma completo. Además, se obtuvieron datos genómicos de bases de datos públicas para 96 individuos que representan diferentes razas de ganado en todo el mundo, incluyendo 23 ganado de Xiangxi de Hunan occidental. El análisis genético indicó que la diversidad genética del ganado de Loudi era similar a la del ganado chino y superior a la de otras razas. El análisis de la estructura poblacional y el origen ancestral indicó la relación entre el ganado de Loudi y otras razas. Loudi tiene cuatro estaciones distintivas, con un clima estereoscópico y recursos hídricos extremadamente ricos. El análisis de barrido selectivo reveló genes y vías candidatas asociadas con la adaptación ambiental y la homeostasis. Nuestros hallazgos proporcionan una valiosa fuente de información sobre la diversidad genética del ganado de Loudi y ideas para la conservación de poblaciones y la cría asociada al genoma del ganado local en el actual entorno climático extremo.
Descripción
Debido a la variabilidad geográfica, cultural y ambiental en Xiangxi, China, se han formado poblaciones de ganado indígena distintivas. Entre ellas, el ganado de Loudi y el ganado de Xiangxi son las razas locales en Hunan, y el entorno en Loudi es relativamente más cerrado y húmedo que en Xiangxi. Para estudiar el genoma y el origen del ganado de Loudi en ambientes cálidos y húmedos, se recolectaron y secuenciaron 29 individuos mediante resecuenciación de genoma completo. Además, se obtuvieron datos genómicos de bases de datos públicas para 96 individuos que representan diferentes razas de ganado en todo el mundo, incluyendo 23 ganado de Xiangxi de Hunan occidental. El análisis genético indicó que la diversidad genética del ganado de Loudi era similar a la del ganado chino y superior a la de otras razas. El análisis de la estructura poblacional y el origen ancestral indicó la relación entre el ganado de Loudi y otras razas. Loudi tiene cuatro estaciones distintivas, con un clima estereoscópico y recursos hídricos extremadamente ricos. El análisis de barrido selectivo reveló genes y vías candidatas asociadas con la adaptación ambiental y la homeostasis. Nuestros hallazgos proporcionan una valiosa fuente de información sobre la diversidad genética del ganado de Loudi y ideas para la conservación de poblaciones y la cría asociada al genoma del ganado local en el actual entorno climático extremo.