logo móvil
Contáctanos

Genómica filogenia utilizando el clasificador Maxwell basado en la transformación de Burrows-Wheeler

Autores: Demongeot, Jacques; Gardes, Joël; Maldivi, Christophe; Boisset, Denis; Boufama, Kenza; Touzouti, Imène

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2023

Descargar PDF

Acceso abierto

Artículo científico
2023

Genómica filogenia utilizando el clasificador Maxwell basado en la transformación de Burrows-Wheeler


Categoría

Ingeniería y Tecnología

Subcategoría

Ingeniería de Sistemas

Palabras clave

Anillo
Genoma
ARN
Péptidos
Evolución
Clasificador

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 19

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
Antecedentes: En los genomas actuales, aparecen reliquias de un ARN circular que podrían haber desempeñado un papel central como catalizador primitivo de la génesis de péptidos. Métodos: Utilizando una medida de proximidad a este ARN circular y la distancia, se ha construido un nuevo clasificador no supervisado llamado Maxwell basado en el algoritmo de transformación de Burrows-Wheeler. Resultados: Al aplicar el clasificador a numerosos genomas de diversos reinos (Bacterias, Arqueas, Vegetales y Animales), obtenemos árboles filogenéticos que son coherentes con árboles biológicos basados en argumentos evolutivos puros. Discusión: Discutimos el papel de los operadores combinatorios responsables de la evolución del genoma de muchas especies. Conclusiones: Hemos abierto posibilidades para entender los mecanismos de una fábrica primitiva de péptidos representada por un anillo de ARN. Mostramos que este anillo fue capaz de transmitir algunas de sus subsecuencias en las secuencias de genes involucrados en los mecanismos de la producción ribosomal actual de proteínas.

Otros recursos que podrían interesarte

Temas Virtualpro