La carne de cerdo es una fuente de proteína indispensable para los humanos. Aclarar la base genética de la adaptabilidad y domesticación de los cerdos promoverá el proceso de cría. En este estudio, se seleccionaron numerosos genes candidatos relacionados con la adaptación ambiental, la domesticación y la selección artificial de los cerdos a través de un análisis de barrido de selección a nivel genómico. En particular, algunos genes ubicados en regiones del complejo mayor de histocompatibilidad también estaban bajo selección durante la domesticación y la selección artificial. El análisis comparativo filogenético reveló diferencias obvias en la distribución poblacional y la historia de manejo entre los haplotipos de la región MHC/MHC II y los genotipos a nivel genómico. Estos hallazgos mejoran nuestra comprensión teórica de la adaptabilidad ambiental y la domesticación de los cerdos y ofrecen valiosas perspectivas para la cría de resistencia a enfermedades en cerdos.