El ganado Nanyang es una de las razas locales más valiosas de China, conocido por su fuerza, temperamento tranquilo y capacidad para sobrevivir en entornos difíciles. Sin embargo, al igual que muchos animales tradicionales, enfrentan amenazas de las prácticas agrícolas modernas que pueden reducir la diversidad genética, lo que significa el rango de rasgos que se transmiten de una generación a la siguiente. En este estudio, comparamos dos grupos de ganado Nanyang: uno mantenido en un programa oficial de conservación y otro que vive libremente en regiones montañosas. Encontramos que ambos grupos comparten los mismos orígenes, pero el ganado que pastorea libremente preservó más variación natural y genes vinculados a la resistencia a enfermedades y adaptación, mientras que el grupo de conservación mostró efectos más fuertes de la selección humana por rasgos como el crecimiento. Notablemente, se identificaron 170 genes que desempeñan roles importantes en la adaptación ambiental. Estos resultados muestran que conservar el ganado Nanyang requiere un equilibrio cuidadoso entre mejorar la productividad y preservar la resiliencia natural. Proteger los recursos genéticos de esta raza no solo ayudará a los agricultores de hoy, sino que también salvaguardará la seguridad alimentaria futura y garantizará la sostenibilidad de la ganadería.