Una Evaluación Genómica de Seis Líneas Inbred Seleccionadas de las Plantas Naturalizadas de Cardo Lechoso (L. Gaertn.) en Corea
Autores: Shim, Jeehyoung; Hong, Su Young; Han, Jae-Hyuk; Yu, Yeisoo; Yoo, Eunae; Sung, Jungsook; Chin, Joong Hyoun; Lee, O New
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Una Evaluación Genómica de Seis Líneas Inbred Seleccionadas de las Plantas Naturalizadas de Cardo Lechoso (L. Gaertn.) en Corea
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Cardo mariano
Silimarina
Enfermedad hepática crónica
Investigación genómica
Marcador molecular
Diversidad genética
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 10
Citaciones: Sin citaciones
El cardo mariano pertenece a la familia Asteraceae y es una planta medicinal nativa de la cuenca mediterránea. La silimarina en el aquenio es un producto herbal ampliamente utilizado para enfermedades crónicas del hígado. Hay un creciente interés en la medicina natural que utiliza el cardo mariano en Corea, pero la materia prima depende completamente de importaciones. A pesar de su importancia económica, no se han realizado evaluaciones fenotípicas de los recursos nativos de cardo mariano en Corea. Además, la investigación genómica y el desarrollo de marcadores moleculares son muy limitados en el cardo mariano. En este estudio, evaluamos 220 recursos de cardo mariano que consisten en 172 accesiones recolectadas del mercado nacional y 48 accesiones aisladas de 6 accesiones distribuidas por el Centro Nacional de Agrobiodiversidad en Corea. Se midieron seis características de la planta (altura, peso de la semilla, número de flores, peso de la semilla por flor, longitud de espinas y color en la cosecha), y se seleccionaron seis muestras (M01-M06) para representar la diversidad genética de la población para la investigación genómica. Para desarrollar marcadores de inserción/eliminación (InDel) basados en PCR y co-dominantes, realizamos la detección de InDel a nivel genómico comparando los datos de resecuenciación del genoma completo de las seis accesiones seleccionadas con la secuencia del genoma de referencia (GCA_001541825). Como resultado, se seleccionaron 177 marcadores InDel con alta distinguibilidad y reproducibilidad de las 30,845 variantes InDel. Los recursos de plantas alienígenas importados sin saber podrían mezclarse genéticamente con facilidad, y la pureza de las semillas en peligro podría causar dificultades continuas en el desarrollo de plataformas agrícolas de alto valor añadido que utilicen productos naturales. Los materiales vegetales seleccionados y los 177 marcadores InDel validados desarrollados a través del análisis de resecuenciación del genoma completo podrían ser recursos valiosos para la cría, conservación y estudios ecológicos de nativos de Corea, junto con la aceleración de la industrialización.
Descripción
El cardo mariano pertenece a la familia Asteraceae y es una planta medicinal nativa de la cuenca mediterránea. La silimarina en el aquenio es un producto herbal ampliamente utilizado para enfermedades crónicas del hígado. Hay un creciente interés en la medicina natural que utiliza el cardo mariano en Corea, pero la materia prima depende completamente de importaciones. A pesar de su importancia económica, no se han realizado evaluaciones fenotípicas de los recursos nativos de cardo mariano en Corea. Además, la investigación genómica y el desarrollo de marcadores moleculares son muy limitados en el cardo mariano. En este estudio, evaluamos 220 recursos de cardo mariano que consisten en 172 accesiones recolectadas del mercado nacional y 48 accesiones aisladas de 6 accesiones distribuidas por el Centro Nacional de Agrobiodiversidad en Corea. Se midieron seis características de la planta (altura, peso de la semilla, número de flores, peso de la semilla por flor, longitud de espinas y color en la cosecha), y se seleccionaron seis muestras (M01-M06) para representar la diversidad genética de la población para la investigación genómica. Para desarrollar marcadores de inserción/eliminación (InDel) basados en PCR y co-dominantes, realizamos la detección de InDel a nivel genómico comparando los datos de resecuenciación del genoma completo de las seis accesiones seleccionadas con la secuencia del genoma de referencia (GCA_001541825). Como resultado, se seleccionaron 177 marcadores InDel con alta distinguibilidad y reproducibilidad de las 30,845 variantes InDel. Los recursos de plantas alienígenas importados sin saber podrían mezclarse genéticamente con facilidad, y la pureza de las semillas en peligro podría causar dificultades continuas en el desarrollo de plataformas agrícolas de alto valor añadido que utilicen productos naturales. Los materiales vegetales seleccionados y los 177 marcadores InDel validados desarrollados a través del análisis de resecuenciación del genoma completo podrían ser recursos valiosos para la cría, conservación y estudios ecológicos de nativos de Corea, junto con la aceleración de la industrialización.