Identificación y caracterización a nivel genómico de la familia de y su papel en la señalización a larga distancia
Autores: Wu, Huan; Zhu, Ling; Cai, Guiping; Lv, Chenxi; Yang, Huan; Ren, Xiaoli; Hu, Bo; Zhou, Xuemei; Jiang, Tingting; Xiang, Yong; Wei, Rujun; Li, Lujiang; Liu, Hailan; Muhammad, Imran; Xia, Chao; Lan, Hai
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Identificación y caracterización a nivel genómico de la familia de y su papel en la señalización a larga distancia
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Fosfatasa de proteínas 2c
Familia
Maíz
Señalización de nitrógeno
Análisis de expresión
Respuestas al estrés
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 9
Citaciones: Sin citaciones
La fosfatasa de proteínas 2C (PP2C) constituye una gran familia de genes que desempeña roles cruciales en la regulación de las respuestas al estrés y el desarrollo de las plantas. Un estudio reciente ha mostrado la participación de un miembro de la familia en la señalización de nitrógeno a larga distancia en Arabidopsis. Sin embargo, aún no está claro si el maíz adopta un mecanismo similar. En este estudio, realizamos un análisis a nivel genómico y de expresión de la familia PP2C en maíz. Identificamos 103 genes distribuidos en 10 cromosomas, que fueron clasificados en 11 subgrupos basados en un árbol evolutivo. Notablemente, el análisis de elementos cis-actuantes reveló la presencia de abundantes elementos cis relacionados con hormonas y estrés, así como elementos cis relacionados con nitrógeno en las regiones promotoras. El análisis de expresión demostró los patrones de expresión distintos de nueve genes bajo dos tratamientos de nitrógeno. Notablemente, se encontró que la expresión de y en las raíces estaba regulada por señales a larga distancia provenientes de los brotes. Estos hallazgos proporcionan valiosos conocimientos para entender los roles de en la señalización de nitrógeno a larga distancia en maíz.
Descripción
La fosfatasa de proteínas 2C (PP2C) constituye una gran familia de genes que desempeña roles cruciales en la regulación de las respuestas al estrés y el desarrollo de las plantas. Un estudio reciente ha mostrado la participación de un miembro de la familia en la señalización de nitrógeno a larga distancia en Arabidopsis. Sin embargo, aún no está claro si el maíz adopta un mecanismo similar. En este estudio, realizamos un análisis a nivel genómico y de expresión de la familia PP2C en maíz. Identificamos 103 genes distribuidos en 10 cromosomas, que fueron clasificados en 11 subgrupos basados en un árbol evolutivo. Notablemente, el análisis de elementos cis-actuantes reveló la presencia de abundantes elementos cis relacionados con hormonas y estrés, así como elementos cis relacionados con nitrógeno en las regiones promotoras. El análisis de expresión demostró los patrones de expresión distintos de nueve genes bajo dos tratamientos de nitrógeno. Notablemente, se encontró que la expresión de y en las raíces estaba regulada por señales a larga distancia provenientes de los brotes. Estos hallazgos proporcionan valiosos conocimientos para entender los roles de en la señalización de nitrógeno a larga distancia en maíz.