Estudio a Nivel Genómico de Factores de Transcripción PLATZ Específicos de Plantas y Análisis Funcional de en la Regulación del Desarrollo de Caryopsis de Arroz (L.)
Autores: Yang, Tao; Xu, Xin-Tong; Tang, Li-Jun; Wei, Wen-Tao; Zhao, Yuan-Yuan; Liu, Jin-Xin; Yao, Xue-Feng; Zhao, Heng; Liu, Chun-Ming; Bai, Ai-Ning
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
2025
Estudio a Nivel Genómico de Factores de Transcripción PLATZ Específicos de Plantas y Análisis Funcional de en la Regulación del Desarrollo de Caryopsis de Arroz (L.)
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Proteína específica de planta
Proteína que se une al zinc
Secuencias de ADN
Análisis filogenético
Estructuras de proteínas
Patrones de expresión
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 9
Citaciones: Sin citaciones
La secuencia rica en A/T y la proteína de unión al zinc (PLATZ) es un tipo de proteína de unión al ADN dependiente de zinc específica de plantas que se une a secuencias de ADN ricas en A/T. Esta familia es esencial para el crecimiento, desarrollo y respuesta al estrés de las plantas. En este estudio, se identificaron 15 en el genoma de arroz con dominios conservados de PLATZ completos mediante CD-search, similares a los encontrados en angiospermas. El análisis filogenético de múltiples especies mostró que los PLATZ se conservaron en organismos fotosintéticos, y se identificó una rama evolutiva única para angiospermas entre los miembros de la familia PLATZ. Quince OsPLATZ se representaron en cinco grupos, cada uno con características distintas. Un análisis de las estructuras de proteínas y motivos de secuencia mostró que los OsPLATZ eran similares dentro de los grupos, pero variaban entre ellos. El perfil de expresión y los resultados de qRT-PCR mostraron que tenían patrones de expresión distintos en diferentes tejidos, con algunos respondiendo a la inducción de estrés. La mayoría de los OsPLATZ se localizaron en los núcleos y se predijo que se unían a secuencias de ADN mediante AlphaFold3, lo que sugiere que probablemente funcionan como factores de transcripción convencionales. También identificamos un gen específico de caryopsis que regula el llenado de granos y el desarrollo de caryopsis en arroz. Esta investigación sienta las bases para explorar la diversidad estructural, rasgos evolutivos, perfil de expresión y posibles roles de los factores de transcripción PLATZ en arroz.
Descripción
La secuencia rica en A/T y la proteína de unión al zinc (PLATZ) es un tipo de proteína de unión al ADN dependiente de zinc específica de plantas que se une a secuencias de ADN ricas en A/T. Esta familia es esencial para el crecimiento, desarrollo y respuesta al estrés de las plantas. En este estudio, se identificaron 15 en el genoma de arroz con dominios conservados de PLATZ completos mediante CD-search, similares a los encontrados en angiospermas. El análisis filogenético de múltiples especies mostró que los PLATZ se conservaron en organismos fotosintéticos, y se identificó una rama evolutiva única para angiospermas entre los miembros de la familia PLATZ. Quince OsPLATZ se representaron en cinco grupos, cada uno con características distintas. Un análisis de las estructuras de proteínas y motivos de secuencia mostró que los OsPLATZ eran similares dentro de los grupos, pero variaban entre ellos. El perfil de expresión y los resultados de qRT-PCR mostraron que tenían patrones de expresión distintos en diferentes tejidos, con algunos respondiendo a la inducción de estrés. La mayoría de los OsPLATZ se localizaron en los núcleos y se predijo que se unían a secuencias de ADN mediante AlphaFold3, lo que sugiere que probablemente funcionan como factores de transcripción convencionales. También identificamos un gen específico de caryopsis que regula el llenado de granos y el desarrollo de caryopsis en arroz. Esta investigación sienta las bases para explorar la diversidad estructural, rasgos evolutivos, perfil de expresión y posibles roles de los factores de transcripción PLATZ en arroz.