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Ensamblaje de genoma de alta calidad y transcriptoma de Proporcionan información sobre su evolución y respuesta al estrés térmico

Autores: Wang, Zizhuo; Qin, Kunrong; Chen, Wentao; Ma, Guanpeng; Zhan, Yu; Zhu, Haoxiang; Wang, Haiyang

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2025

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Acceso abierto

Artículo científico
2025

Ensamblaje de genoma de alta calidad y transcriptoma de Proporcionan información sobre su evolución y respuesta al estrés térmico


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Botánica

Palabras clave

Especies alpinas
Ensamblaje del genoma
Familias de genes
Estrés térmico
Análisis del transcriptoma
Conservación

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 10

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
() es una especie alpina en peligro de extinción con una distribución altamente restringida en la región suroeste de China, que posee un valor ornamental y hortícola significativo. En este estudio, se informa sobre el ensamblaje del genoma de alta calidad a nivel cromosómico. El tamaño total del genoma se determinó en 642.25 Mb, con un N50 de contig de 25.64 Mb, y contiene 36,522 genes predichos. El análisis genómico comparativo entre y otras especies reveló la expansión de familias de genes, como las relacionadas con la unión de iones metálicos de transición y el transporte de iones de sodio, así como la contracción de familias de genes involucradas en el reconocimiento del polen y la interacción polen-estigma. Estos hallazgos podrían explicar la adaptación de a hábitats rocosos y contribuir a su estado de peligro de extinción. Además, se llevó a cabo un experimento de estrés térmico en , seguido de secuenciación del transcriptoma y co-análisis fisiológico para construir una red de co-expresión. Este análisis identificó el gen candidato y otros factores de transcripción que exhiben expresión diferencial bajo estrés térmico. La secuenciación del genoma completo, el análisis del transcriptoma y el co-análisis fisiológico de proporcionan recursos valiosos para su conservación y ofrecen información sobre sus mecanismos de estrés térmico.

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