Ensamblaje de genoma de alta calidad y transcriptoma de Proporcionan información sobre su evolución y respuesta al estrés térmico
Autores: Wang, Zizhuo; Qin, Kunrong; Chen, Wentao; Ma, Guanpeng; Zhan, Yu; Zhu, Haoxiang; Wang, Haiyang
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
2025
Ensamblaje de genoma de alta calidad y transcriptoma de Proporcionan información sobre su evolución y respuesta al estrés térmico
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Especies alpinas
Ensamblaje del genoma
Familias de genes
Estrés térmico
Análisis del transcriptoma
Conservación
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 10
Citaciones: Sin citaciones
() es una especie alpina en peligro de extinción con una distribución altamente restringida en la región suroeste de China, que posee un valor ornamental y hortícola significativo. En este estudio, se informa sobre el ensamblaje del genoma de alta calidad a nivel cromosómico. El tamaño total del genoma se determinó en 642.25 Mb, con un N50 de contig de 25.64 Mb, y contiene 36,522 genes predichos. El análisis genómico comparativo entre y otras especies reveló la expansión de familias de genes, como las relacionadas con la unión de iones metálicos de transición y el transporte de iones de sodio, así como la contracción de familias de genes involucradas en el reconocimiento del polen y la interacción polen-estigma. Estos hallazgos podrían explicar la adaptación de a hábitats rocosos y contribuir a su estado de peligro de extinción. Además, se llevó a cabo un experimento de estrés térmico en , seguido de secuenciación del transcriptoma y co-análisis fisiológico para construir una red de co-expresión. Este análisis identificó el gen candidato y otros factores de transcripción que exhiben expresión diferencial bajo estrés térmico. La secuenciación del genoma completo, el análisis del transcriptoma y el co-análisis fisiológico de proporcionan recursos valiosos para su conservación y ofrecen información sobre sus mecanismos de estrés térmico.
Descripción
() es una especie alpina en peligro de extinción con una distribución altamente restringida en la región suroeste de China, que posee un valor ornamental y hortícola significativo. En este estudio, se informa sobre el ensamblaje del genoma de alta calidad a nivel cromosómico. El tamaño total del genoma se determinó en 642.25 Mb, con un N50 de contig de 25.64 Mb, y contiene 36,522 genes predichos. El análisis genómico comparativo entre y otras especies reveló la expansión de familias de genes, como las relacionadas con la unión de iones metálicos de transición y el transporte de iones de sodio, así como la contracción de familias de genes involucradas en el reconocimiento del polen y la interacción polen-estigma. Estos hallazgos podrían explicar la adaptación de a hábitats rocosos y contribuir a su estado de peligro de extinción. Además, se llevó a cabo un experimento de estrés térmico en , seguido de secuenciación del transcriptoma y co-análisis fisiológico para construir una red de co-expresión. Este análisis identificó el gen candidato y otros factores de transcripción que exhiben expresión diferencial bajo estrés térmico. La secuenciación del genoma completo, el análisis del transcriptoma y el co-análisis fisiológico de proporcionan recursos valiosos para su conservación y ofrecen información sobre sus mecanismos de estrés térmico.