La enfermedad de necrosis hepatopancreática aguda (AHPND) es una de las enfermedades más importantes en la industria global del camarón. La aparición de cepas mutantes asociadas a AHPND ha generado preocupaciones sobre posibles diagnósticos erróneos y patogenicidad imprevista. En este estudio, informamos sobre la primera aparición de un mutante natural tipo II, aislado de cultivos en Corea. Los análisis fenotípicos y genéticos revelaron una estrecha relación entre la cepa mutante 20-082A3 y la cepa virulenta coreana 19-021-D1, que causó un brote en 2019. Un análisis detallado de la secuencia de los plásmidos asociados a AHPND mostró que el plásmido pVp_20-082A3B en la cepa 20-082A3 era casi idéntico (>99.9%) al de la cepa 19-021-D1. Además, las cepas 20-082A3 y 19-021-D1 exhibieron el mismo tipo de secuencia multilocus (ST 413) y serotipo (O1: no tipificable K-serogrupo), lo que sugiere que la cepa mutante está estrechamente relacionada y puede haber originado de la cepa virulenta 19-021-D1. Al igual que en informes anteriores sobre el mutante natural, la cepa 20-082A3 no indujo síntomas relacionados con AHPND ni causó mortalidad en el bioensayo con camarones. La aparición de una cepa mutante que es casi idéntica a la virulenta resalta la necesidad de vigilancia del patógeno prevalente en Corea. Se necesitan más investigaciones para dilucidar la posible relación entre ST 413 y los aislamientos recientes de Corea.