Secuencia del genoma completo y características de fermentación de UW0SKVC1: un candidato prometedor para la desintoxicación de hidrolizados de biomasa lignocelulósica y la producción de productos químicos de valor añadido
Autores: Kumar, Santosh; Agyeman-Duah, Eric; Ujor, Victor C.
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Secuencia del genoma completo y características de fermentación de UW0SKVC1: un candidato prometedor para la desintoxicación de hidrolizados de biomasa lignocelulósica y la producción de productos químicos de valor añadido
Categoría
Ingeniería y Tecnología
Subcategoría
Bioingeniería
Palabras clave
Complejo
Bacterias
Genoma
Furfural
HMF
Biocatalizador
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 33
Citaciones: Sin citaciones
Es parte del complejo (ECC), que es común en la naturaleza. Es una bacteria facultativa Gram-negativa de importancia médica e industrial. Evaluamos los repertorios metabólicos y genéticos de un nuevo aislado. Aquí, informamos la secuencia del genoma completo de una cepa tolerante a furfural y 5-hidroximetil furfural (HMF) (UW0SKVC1), que utiliza glucosa, glicerol, xilosa, lactosa y arabinosa como únicas fuentes de carbono. Esta cepa muestra una alta tolerancia al furfural (IC = 34,2 mM; ~3,3 g/L) en comparación con DH5alpha (IC = 26,0 mM; ~2,5 g/L). El furfural y el HMF se convierten principalmente en sus alcoholes menos tóxicos. UW0SKVC1 produce 2,3-butanodiol, acetoina y acetol, entre otros compuestos de importancia industrial. UW0SKVC1 produce hasta ~42 g/L de 2,3-butanodiol en 60 g/L de glucosa o lactosa. El genoma ensamblado consta de un cromosoma de 4,833,490 pb, con un contenido de GC del 55,35%. La anotación del genoma ensamblado reveló 4586 secuencias codificantes y 4516 genes codificantes de proteínas (longitud promedio de 937 pb) involucrados en el metabolismo central, generación de energía, biodegradación de compuestos xenobióticos, producción de diversos compuestos orgánicos y resistencia a fármacos. UW0SKVC1 muestra un considerable potencial como biocatalizador y como repositorio genético de genes cuyos productos proteicos pueden ser aprovechados para la bioconversión eficiente de biomasa lignocelulósica, glicerol abundante y permeado de suero de lactosa a productos químicos de valor añadido.
Descripción
Es parte del complejo (ECC), que es común en la naturaleza. Es una bacteria facultativa Gram-negativa de importancia médica e industrial. Evaluamos los repertorios metabólicos y genéticos de un nuevo aislado. Aquí, informamos la secuencia del genoma completo de una cepa tolerante a furfural y 5-hidroximetil furfural (HMF) (UW0SKVC1), que utiliza glucosa, glicerol, xilosa, lactosa y arabinosa como únicas fuentes de carbono. Esta cepa muestra una alta tolerancia al furfural (IC = 34,2 mM; ~3,3 g/L) en comparación con DH5alpha (IC = 26,0 mM; ~2,5 g/L). El furfural y el HMF se convierten principalmente en sus alcoholes menos tóxicos. UW0SKVC1 produce 2,3-butanodiol, acetoina y acetol, entre otros compuestos de importancia industrial. UW0SKVC1 produce hasta ~42 g/L de 2,3-butanodiol en 60 g/L de glucosa o lactosa. El genoma ensamblado consta de un cromosoma de 4,833,490 pb, con un contenido de GC del 55,35%. La anotación del genoma ensamblado reveló 4586 secuencias codificantes y 4516 genes codificantes de proteínas (longitud promedio de 937 pb) involucrados en el metabolismo central, generación de energía, biodegradación de compuestos xenobióticos, producción de diversos compuestos orgánicos y resistencia a fármacos. UW0SKVC1 muestra un considerable potencial como biocatalizador y como repositorio genético de genes cuyos productos proteicos pueden ser aprovechados para la bioconversión eficiente de biomasa lignocelulósica, glicerol abundante y permeado de suero de lactosa a productos químicos de valor añadido.