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Caracterización del Genoma Mitocondrial Completo de (Cypriniformes, Cyprinidae, Schizothorax) y Perspectivas sobre las Relaciones Filogenéticas de

Autores: Qin, Qiang; Chen, Lin; Zhang, Fubin; Xu, Jianghaoyue; Zeng, Yu

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2024

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Acceso abierto

Artículo científico
2024

Caracterización del Genoma Mitocondrial Completo de (Cypriniformes, Cyprinidae, Schizothorax) y Perspectivas sobre las Relaciones Filogenéticas de


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Zootecnia

Palabras clave

Endémico
Vulnerable
Genoma mitocondrial
Relaciones filogenéticas
Recursos poblacionales
Conservación

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 8

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
es una especie de pez endémica y vulnerable que se encuentra en el río Yangtsé superior en China. En los últimos años, los recursos poblacionales de han sido casi completamente agotados debido a múltiples amenazas contribuyentes. Si bien los genomas mitocondriales completos sirven como importantes marcadores moleculares para estudios filogenéticos y genéticos, el genoma mitocondrial de aún ha recibido poca atención. En este estudio, analizamos la caracterización del genoma mitocondrial de e investigamos las relaciones filogenéticas de . El genoma mitocondrial completo de tenía 16,585 pb de longitud, que contenía treinta y siete genes (trece genes que codifican proteínas (PCGs), dos genes de ARN ribosómico (rRNAs), veintidós genes de ARN de transferencia (tRNAs)) y dos regiones no codificantes para el origen de la cadena ligera (OL) y la región de control (CR). Había nueve regiones superpuestas y diecisiete regiones de espaciadores intergénicos en el genoma mitocondrial. El genoma también mostró un sesgo hacia el contenido de A + T (55.01%) y tenía un sesgo AT positivo (0.08) y un sesgo GC negativo (-0.20). Todos los PCGs emplearon el ATG o GTG como codón de inicio y TAA, TAG o un solo T como codón de parada. Además, todos los tRNAs mostraron una estructura secundaria típica de trébol, excepto trnS1 que carecía del brazo D. El análisis filogenético, basado en los métodos de máxima verosimilitud (ML) e inferencia bayesiana (BI), reveló que las topologías del árbol filogenético dividieron en cuatro clados y no apoyaron la clasificación de basada en la morfología. El estatus filogenético de estaba estrechamente relacionado con el de . El presente estudio proporciona información genómica valiosa para y nuevas perspectivas en las relaciones filogenéticas de . Estos datos también podrían ofrecer referencias y pautas fundamentales para la gestión y conservación de y otras especies de .

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