Identificación a nivel del genoma, caracterización y análisis de expresión de la familia de factores de transcripción NAC en cerezo dulce (L.)
Autores: An, Feng; Yin, Xin; Jueraiti, Kaibire; Yang, Yuanyuan; Yan, Zhuoyang; Li, Jie; Shan, Dongqian
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
2025
Identificación a nivel del genoma, caracterización y análisis de expresión de la familia de factores de transcripción NAC en cerezo dulce (L.)
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Factor de transcripción
Cereza dulce
Adaptación
Estrés abiótico
Análisis filogenético
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 16
Citaciones: Sin citaciones
La familia NAC (NAM, ATAF1/2 y CUC2) es una de las familias de factores de transcripción específicos de plantas más grandes, desempeñando un papel crucial en la adaptación a estrés abiótico. Sin embargo, la familia de genes en la cereza dulce (L.) sigue siendo poco comprendida. En este estudio, identificamos 130 genes del genoma de la cereza dulce, que estaban distribuidos de manera desigual en ocho cromosomas. El análisis filogenético clasificó los PaNACs en 21 grupos distintos, incluidos 2 grupos específicos de cereza dulce. El análisis comparativo reveló variaciones significativas en las proporciones de genes, estructuras de exones-intrones y composiciones de motivos entre diferentes grupos. Además, el análisis de elementos cis sugirió los roles potenciales de en la regulación del crecimiento de las plantas, el desarrollo, la señalización hormonal y las respuestas al estrés. Los datos transcriptómicos revelaron patrones de expresión específicos de tejido para varios genes. El qRT-PCR confirmó además que ocho seleccionados eran sensibles a varios estreses abióticos en Gisela 6, un portainjerto híbrido ampliamente utilizado en la producción de cereza dulce que comparte alta similitud de secuencia en genes con. Estos hallazgos proporcionan valiosos conocimientos para futuras investigaciones sobre las características funcionales de los genes en el crecimiento, desarrollo y respuestas al estrés abiótico en la cereza dulce.
Descripción
La familia NAC (NAM, ATAF1/2 y CUC2) es una de las familias de factores de transcripción específicos de plantas más grandes, desempeñando un papel crucial en la adaptación a estrés abiótico. Sin embargo, la familia de genes en la cereza dulce (L.) sigue siendo poco comprendida. En este estudio, identificamos 130 genes del genoma de la cereza dulce, que estaban distribuidos de manera desigual en ocho cromosomas. El análisis filogenético clasificó los PaNACs en 21 grupos distintos, incluidos 2 grupos específicos de cereza dulce. El análisis comparativo reveló variaciones significativas en las proporciones de genes, estructuras de exones-intrones y composiciones de motivos entre diferentes grupos. Además, el análisis de elementos cis sugirió los roles potenciales de en la regulación del crecimiento de las plantas, el desarrollo, la señalización hormonal y las respuestas al estrés. Los datos transcriptómicos revelaron patrones de expresión específicos de tejido para varios genes. El qRT-PCR confirmó además que ocho seleccionados eran sensibles a varios estreses abióticos en Gisela 6, un portainjerto híbrido ampliamente utilizado en la producción de cereza dulce que comparte alta similitud de secuencia en genes con. Estos hallazgos proporcionan valiosos conocimientos para futuras investigaciones sobre las características funcionales de los genes en el crecimiento, desarrollo y respuestas al estrés abiótico en la cereza dulce.