Análisis del genoma de cepas aisladas de suelos de permafrost con edades que oscilan entre 15 mil y 1.8 millones de años reveló sus estrechas relaciones con aislamientos ambientales y clínicos actuales
Autores: Rakitin, Andrey L.; Ermakova, Alexandra Y.; Beletsky, Alexey V.; Petrova, Mayya; Mardanov, Andrey V.; Ravin, Nikolai V.
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2021
Acceso abierto
Artículo científico
2021
Análisis del genoma de cepas aisladas de suelos de permafrost con edades que oscilan entre 15 mil y 1.8 millones de años reveló sus estrechas relaciones con aislamientos ambientales y clínicos actuales
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Vida microbiana
Permafrost
Análisis genómico
Cepas
Aislados clínicos
Características genéticas
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 17
Citaciones: Sin citaciones
La vida microbiana puede ser sostenida a temperaturas bajo cero en el permafrost de hasta varios millones de años. El análisis del genoma de cepas aisladas del permafrost proporciona una oportunidad única para estudiar microorganismos que no han tenido contacto previo con la población humana. es una bacteria del suelo típica que ha sido reportada cada vez más como patógenos hospitalarios asociados con bacteriemia. Con el fin de identificar las características genéticas específicas de cepas antiguas conservadas en permafrost y sus diferencias con los aislados clínicos actuales, llevamos a cabo un análisis genómico de cinco cepas aisladas del permafrost con edades de 15 mil a 1.8 millones de años. Sorprendentemente, no identificamos determinantes genéticos cromosómicos que distingan las cepas de permafrost de los aislados clínicos y cepas de otros hábitats naturales. El análisis filogenético basado en secuencias de genoma completo mostró que las cepas de permafrost no forman un clúster separado y algunas de ellas están más estrechamente relacionadas con los aislados clínicos. Los genomas de las cepas clínicas y de permafrost contienen elementos móviles y profagos similares, lo que indica un intenso intercambio horizontal de material genético. La comparación de plásmidos de cepas modernas y de permafrost mostró que los plásmidos de las cepas modernas están enriquecidos con genes de resistencia a antibióticos, mientras que el contenido de genes para resistencia a metales pesados y arsénico es casi el mismo. El deshielo del permafrost causado por el calentamiento global podría liberar nuevas cepas potencialmente patógenas de .
Descripción
La vida microbiana puede ser sostenida a temperaturas bajo cero en el permafrost de hasta varios millones de años. El análisis del genoma de cepas aisladas del permafrost proporciona una oportunidad única para estudiar microorganismos que no han tenido contacto previo con la población humana. es una bacteria del suelo típica que ha sido reportada cada vez más como patógenos hospitalarios asociados con bacteriemia. Con el fin de identificar las características genéticas específicas de cepas antiguas conservadas en permafrost y sus diferencias con los aislados clínicos actuales, llevamos a cabo un análisis genómico de cinco cepas aisladas del permafrost con edades de 15 mil a 1.8 millones de años. Sorprendentemente, no identificamos determinantes genéticos cromosómicos que distingan las cepas de permafrost de los aislados clínicos y cepas de otros hábitats naturales. El análisis filogenético basado en secuencias de genoma completo mostró que las cepas de permafrost no forman un clúster separado y algunas de ellas están más estrechamente relacionadas con los aislados clínicos. Los genomas de las cepas clínicas y de permafrost contienen elementos móviles y profagos similares, lo que indica un intenso intercambio horizontal de material genético. La comparación de plásmidos de cepas modernas y de permafrost mostró que los plásmidos de las cepas modernas están enriquecidos con genes de resistencia a antibióticos, mientras que el contenido de genes para resistencia a metales pesados y arsénico es casi el mismo. El deshielo del permafrost causado por el calentamiento global podría liberar nuevas cepas potencialmente patógenas de .