Caracterización del genoma de una especie degradadora de isopreno aislada de un bosque restaurado tropical
Autores: Uttarotai, Toungporn; Sutheeworapong, Sawannee; Crombie, Andrew T.; Murrell, J. Colin; Mhuantong, Wuttichai; Noirungsee, Nuttapol; Wangkarn, Sunanta; Bovonsombut, Sakunnee; McGenity, Terry J.; Chitov, Thararat
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2022
Acceso abierto
Artículo científico
2022
Caracterización del genoma de una especie degradadora de isopreno aislada de un bosque restaurado tropical
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Isopreno
Bacteria del suelo
Cepa 13f
Degradación
Cepa sp. 13f
Metabolismo del isopreno
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 14
Citaciones: Sin citaciones
El isopreno es un compuesto orgánico volátil biogénico (BVOC) activo en el clima, emitido a la atmósfera en abundancia, principalmente por plantas terrestres. El suelo es un sumidero importante para el isopreno debido a su consumo por parte de microbios. En este estudio, informamos sobre la capacidad de una bacteria del suelo para degradar isopreno. La cepa 13f fue aislada del suelo debajo de árboles silvestres de cerezo del Himalaya en un bosque restaurado tropical. Basado en un análisis filogenómico y un puntaje de Identidad Nucleotídica Promedio de >95%, probablemente pertenece a la especie. La degradación de isopreno por la cepa sp. 13f se midió utilizando cromatografía de gases. Cuando el isopreno se suministró como la única fuente de carbono y energía a la concentración de 7.2 x 10 ppbv y 7.2 x 10 ppbv, se consumió el 32.6% y el 19.6% de isopreno después de 18 días, respectivamente. El análisis del genoma de la cepa sp. 13f reveló que los genes que se encuentran típicamente como parte del grupo génico de la monooxigenasa de isopreno en otras bacterias degradadoras de isopreno estaban ausentes. Este descubrimiento sugiere que puede haber vías alternativas para el metabolismo del isopreno.
Descripción
El isopreno es un compuesto orgánico volátil biogénico (BVOC) activo en el clima, emitido a la atmósfera en abundancia, principalmente por plantas terrestres. El suelo es un sumidero importante para el isopreno debido a su consumo por parte de microbios. En este estudio, informamos sobre la capacidad de una bacteria del suelo para degradar isopreno. La cepa 13f fue aislada del suelo debajo de árboles silvestres de cerezo del Himalaya en un bosque restaurado tropical. Basado en un análisis filogenómico y un puntaje de Identidad Nucleotídica Promedio de >95%, probablemente pertenece a la especie. La degradación de isopreno por la cepa sp. 13f se midió utilizando cromatografía de gases. Cuando el isopreno se suministró como la única fuente de carbono y energía a la concentración de 7.2 x 10 ppbv y 7.2 x 10 ppbv, se consumió el 32.6% y el 19.6% de isopreno después de 18 días, respectivamente. El análisis del genoma de la cepa sp. 13f reveló que los genes que se encuentran típicamente como parte del grupo génico de la monooxigenasa de isopreno en otras bacterias degradadoras de isopreno estaban ausentes. Este descubrimiento sugiere que puede haber vías alternativas para el metabolismo del isopreno.