Identificación y caracterización del genoma completo de la familia de genes DKK y sus perfiles de transcripción: un análisis de la tortuga de caparazón blando china ()
Autores: Wang, Yongchang; Zhu, Junxian; Chen, Chen; Ji, Liqin; Hong, Xiaoyou; Liu, Xiaoli; Chen, Haigang; Wei, Chengqing; Zhang, Junjie; Zhu, Xinping; Li, Wei
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Identificación y caracterización del genoma completo de la familia de genes DKK y sus perfiles de transcripción: un análisis de la tortuga de caparazón blando china ()
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
Familia dkk
Familia de genes
Métodos de bioinformática
Filogenia
Perfiles transcripcionales
Diferenciación sexual
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 9
Citaciones: Sin citaciones
La familia DKK es una familia canónica pequeña de antagonistas de WNT. Aunque estudios recientes han sugerido que la familia de genes DKK puede estar involucrada en la diferenciación sexual en , todavía hay muchas cosas sobre la familia de genes DKK que no sabemos. En este estudio, utilizamos métodos bioinformáticos para identificar miembros de la familia de genes DKK en y analizamos su filogenia, covarianza, estructura genética, dominios estructurales, sitios conservados en el promotor, péptidos señal, factores de transcripción gonadales, perfiles de transcripción y perfiles de expresión tisular. Además, se utilizaron resultados de qRT-PCR para la validación e investigación preliminar de la función de la familia de genes DKK en . Los resultados mostraron que la familia de genes DKK se divide en seis subfamilias, distribuidas en seis andamiajes cromosómicos diferentes que contienen diferentes estructuras genéticas y motivos conservados con los mismos dominios estructurales, y todos los miembros eran proteínas secretadas. Nuestro perfilado de transcripción y análisis de expresión embrionaria mostraron que y se expresaron significativamente en los testículos, mientras que y se regulaban significativamente al alza en los ovarios. Esto sugiere una función potencial en la diferenciación sexual en . Nuestros resultados pueden proporcionar una base teórica básica para el proceso de diferenciación sexual en .
Descripción
La familia DKK es una familia canónica pequeña de antagonistas de WNT. Aunque estudios recientes han sugerido que la familia de genes DKK puede estar involucrada en la diferenciación sexual en , todavía hay muchas cosas sobre la familia de genes DKK que no sabemos. En este estudio, utilizamos métodos bioinformáticos para identificar miembros de la familia de genes DKK en y analizamos su filogenia, covarianza, estructura genética, dominios estructurales, sitios conservados en el promotor, péptidos señal, factores de transcripción gonadales, perfiles de transcripción y perfiles de expresión tisular. Además, se utilizaron resultados de qRT-PCR para la validación e investigación preliminar de la función de la familia de genes DKK en . Los resultados mostraron que la familia de genes DKK se divide en seis subfamilias, distribuidas en seis andamiajes cromosómicos diferentes que contienen diferentes estructuras genéticas y motivos conservados con los mismos dominios estructurales, y todos los miembros eran proteínas secretadas. Nuestro perfilado de transcripción y análisis de expresión embrionaria mostraron que y se expresaron significativamente en los testículos, mientras que y se regulaban significativamente al alza en los ovarios. Esto sugiere una función potencial en la diferenciación sexual en . Nuestros resultados pueden proporcionar una base teórica básica para el proceso de diferenciación sexual en .