El análisis de todo el genoma reveló candidatos de genes asociados con la resistencia a la marchitez bacteriana en berenjena ( L.)
Autores: Jiang, Yaolan; Li, Zhiliang; Li, Wenxiang; Cheng, Hefen; Zhao, Wei; Li, Tao; Sun, Baojuan; You, Qian; Zhou, Dinggang
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
El análisis de todo el genoma reveló candidatos de genes asociados con la resistencia a la marchitez bacteriana en berenjena ( L.)
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
Genes
Familias de genes de resistencia
Genoma de berenjena
CNLs
TNLs
RNLs
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 30
Citaciones: Sin citaciones
Los genes constituyen una de las familias de genes de resistencia más grandes en las plantas, que desempeñan roles clave en la resistencia a patógenos. Aunque la identificación y caracterización de la familia de genes ha sido ampliamente informada en varias especies, un análisis exhaustivo en berenjena no ha sido documentado previamente. En este estudio, se identificaron un total de 269 genes en el genoma de la berenjena. Basados en la clasificación de dominios y el análisis filogenético, se dividieron en tres subgrupos: 231 CNLs (CC-NBS-LRR), 36 TNLs (TIR-NBS-LRR) y 2 RNLs (RPW8-NBS-LRR). El análisis de mapeo cromosómico reveló una distribución desigual en grupos a lo largo de los cromosomas, con una presencia predominante en los cromosomas 10, 11 y 12. El análisis estructural identificó ocho motivos conservados previamente reportados en , mostrando una alta conservación tanto en las secuencias de aminoácidos como en su orden. El análisis evolutivo demostró que los eventos de duplicación en tándem contribuyeron principalmente a la expansión de . Posteriormente, el análisis de qRT-PCR demostró que nueve mostraron patrones de expresión diferencial en respuesta al estrés, potencialmente involucrados en la respuesta de resistencia. En conclusión, este estudio proporciona una visión integral de , lo cual mejorará la investigación sobre la resistencia a enfermedades en berenjena y facilitará la cría de nuevas variedades resistentes a enfermedades.
Descripción
Los genes constituyen una de las familias de genes de resistencia más grandes en las plantas, que desempeñan roles clave en la resistencia a patógenos. Aunque la identificación y caracterización de la familia de genes ha sido ampliamente informada en varias especies, un análisis exhaustivo en berenjena no ha sido documentado previamente. En este estudio, se identificaron un total de 269 genes en el genoma de la berenjena. Basados en la clasificación de dominios y el análisis filogenético, se dividieron en tres subgrupos: 231 CNLs (CC-NBS-LRR), 36 TNLs (TIR-NBS-LRR) y 2 RNLs (RPW8-NBS-LRR). El análisis de mapeo cromosómico reveló una distribución desigual en grupos a lo largo de los cromosomas, con una presencia predominante en los cromosomas 10, 11 y 12. El análisis estructural identificó ocho motivos conservados previamente reportados en , mostrando una alta conservación tanto en las secuencias de aminoácidos como en su orden. El análisis evolutivo demostró que los eventos de duplicación en tándem contribuyeron principalmente a la expansión de . Posteriormente, el análisis de qRT-PCR demostró que nueve mostraron patrones de expresión diferencial en respuesta al estrés, potencialmente involucrados en la respuesta de resistencia. En conclusión, este estudio proporciona una visión integral de , lo cual mejorará la investigación sobre la resistencia a enfermedades en berenjena y facilitará la cría de nuevas variedades resistentes a enfermedades.