En este estudio, detectamos 12 bandadas de patos y 11 bandadas de gansos que fueron positivas para el virus de la hepatitis B de pato (DHBV) utilizando la reacción en cadena de la polimerasa e isolamos 23 cepas entre 2020 y 2022 en China. Los genomas completos de las cepas de ganso E200801 y E210501 compartieron la mayor identidad (99.9%), mientras que los de las cepas Y220217 y E210526 compartieron la menor identidad (91.39%). El árbol filogenético construido basado en las secuencias genómicas de estas cepas y cepas de referencia se clasificó en tres grupos principales: la rama china DHBV-I, la rama china DHBV-II y la rama occidental DHBV-III. Además, la cepa de origen pato Y200122 se agrupó en una rama separada y se predijo que era una cepa recombinante derivada de DHBV-M32990 (perteneciente a la rama china DHBV-I) y Y220201 (perteneciente a la rama china DHBV-II). Adicionalmente, el análisis de la proteína preS de las 23 cepas de DHBV reveló extensos sitios de mutación, casi la mitad de los cuales eran de origen pato. Todos los DHBV de origen ganso contenían el sitio de mutación G133E, que está relacionado con una mayor patogenicidad viral. Se espera que estos datos promuevan una mayor investigación sobre la epidemiología y evolución del DHBV. La vigilancia continua del DHBV en aves de corral mejorará la comprensión de la evolución del HBV.