La genética y la nutrición impulsan la sucesión de la microbiota intestinal y las interacciones del transcriptoma del hospedador a lo largo del ciclo de producción de la dorada (Sparus aurata)
Autores: Naya-Català, Fernando; Piazzon, M. Carla; Torrecillas, Silvia; Toxqui-Rodríguez, Socorro; Calduch-Giner, Josep À.; Fontanillas, Ramón; Sitjà-Bobadilla, Ariadna; Montero, Daniel; Pérez-Sánchez, Jaume
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2022
Acceso abierto
Artículo científico
2022
La genética y la nutrición impulsan la sucesión de la microbiota intestinal y las interacciones del transcriptoma del hospedador a lo largo del ciclo de producción de la dorada (Sparus aurata)
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Pez
Antecedentes genéticos
Microbiota
Composición de la dieta
Expresión génica
Salud intestinal
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 18
Citaciones: Sin citaciones
Los peces seleccionados genéticamente para el crecimiento (GS) y los peces de referencia (REF) fueron alimentados con dietas CTRL (15% FM, 5-7% FO) o FUTURE (7.5% FM, 10% harina de pollo, 2.2% aceite de pollo + 2.5% aceite de algas DHA) durante un ciclo de producción de 12 meses. Se utilizaron muestras de puntos de muestreo inicial (t; noviembre de 2019), intermedio (t; julio de 2020) y final (t; noviembre de 2020) para la secuenciación del gen 16S rRNA de Illumina de la microbiota adherente del intestino anterior (AI). Las muestras de los mismos individuos (t) también se utilizaron para el perfil de expresión génica de AI mediante RNA-seq y análisis de correlación subsiguientes con las abundancias de microbiota. Los análisis discriminantes indicaron la sucesión bacteriana intestinal a lo largo del ciclo de producción con la proliferación de algunos taxones valiosos para enfrentar la estacionalidad y diferentes etapas de desarrollo. Se evidenció un efecto del fondo genético a lo largo del tiempo, disminuyendo a medida que avanzaba el ensayo, a saber, la microbiota intestinal de los peces GS fue menos influenciada por los cambios en la composición de la dieta. Al mismo tiempo, estos peces mostraron hitos transcriptómicos más amplios en el AI para hacer frente a estos cambios. Nuestros resultados destacaron un metabolismo mejorado de esfingolípidos y fosfolípidos intestinales, recambio epitelial y motilidad intestinal en los peces GS, lo que favorecería su mejor rendimiento a pesar de la falta de asociación con cambios en la composición de la microbiota intestinal. Además, en los peces GS, los análisis de correlación apoyaron la participación de diferentes taxones con la expresión regulada a la baja de marcadores proinflamatorios y el impulso de marcadores de remodelación extracelular y respuesta a bacterias. En conjunto, estos hallazgos apoyan la acción combinada del microbioma intestinal y los efectos mediadores transcripcionalmente del huésped para preservar y mejorar la salud y función intestinal en un escenario de diferente rendimiento y potencial de crecimiento.
Descripción
Los peces seleccionados genéticamente para el crecimiento (GS) y los peces de referencia (REF) fueron alimentados con dietas CTRL (15% FM, 5-7% FO) o FUTURE (7.5% FM, 10% harina de pollo, 2.2% aceite de pollo + 2.5% aceite de algas DHA) durante un ciclo de producción de 12 meses. Se utilizaron muestras de puntos de muestreo inicial (t; noviembre de 2019), intermedio (t; julio de 2020) y final (t; noviembre de 2020) para la secuenciación del gen 16S rRNA de Illumina de la microbiota adherente del intestino anterior (AI). Las muestras de los mismos individuos (t) también se utilizaron para el perfil de expresión génica de AI mediante RNA-seq y análisis de correlación subsiguientes con las abundancias de microbiota. Los análisis discriminantes indicaron la sucesión bacteriana intestinal a lo largo del ciclo de producción con la proliferación de algunos taxones valiosos para enfrentar la estacionalidad y diferentes etapas de desarrollo. Se evidenció un efecto del fondo genético a lo largo del tiempo, disminuyendo a medida que avanzaba el ensayo, a saber, la microbiota intestinal de los peces GS fue menos influenciada por los cambios en la composición de la dieta. Al mismo tiempo, estos peces mostraron hitos transcriptómicos más amplios en el AI para hacer frente a estos cambios. Nuestros resultados destacaron un metabolismo mejorado de esfingolípidos y fosfolípidos intestinales, recambio epitelial y motilidad intestinal en los peces GS, lo que favorecería su mejor rendimiento a pesar de la falta de asociación con cambios en la composición de la microbiota intestinal. Además, en los peces GS, los análisis de correlación apoyaron la participación de diferentes taxones con la expresión regulada a la baja de marcadores proinflamatorios y el impulso de marcadores de remodelación extracelular y respuesta a bacterias. En conjunto, estos hallazgos apoyan la acción combinada del microbioma intestinal y los efectos mediadores transcripcionalmente del huésped para preservar y mejorar la salud y función intestinal en un escenario de diferente rendimiento y potencial de crecimiento.