es un protozoo intestinal zoonótico común y causa una serie de síntomas gastrointestinales en humanos y animales a través de la ruta fecal-oral, causando pérdidas económicas y planteando problemas de salud pública. En la actualidad, la prevalencia y la estructura genética de en ovejas y cerdos en la provincia de Shanxi siguen siendo desconocidas. Así, el presente estudio recolectó 492 muestras fecales de ovejas y 362 muestras fecales de cerdos de tres condados representativos en el norte, centro y sur de la provincia de Shanxi para la detección de basado en su gen SSU rRNA. Los resultados mostraron que la prevalencia general de en las ovejas y cerdos examinados fue del 16.26% y 14.09%, respectivamente. Los análisis de secuencias mostraron que se detectaron cuatro subtipos conocidos (ST5, ST10, ST14 y ST30) en ovejas y dos subtipos (ST1 y ST5) en cerdos en este estudio, siendo ST5 el subtipo predominante entre las áreas de estudio. El análisis filogenético mostró que los mismos subtipos se agruparon en la misma rama. Este estudio revela que las ovejas y cerdos en la provincia de Shanxi son hospedadores de múltiples subtipos, incluidos los subtipos zoonóticos (ST1 y ST5), lo que plantea un riesgo para la salud pública. Se proporcionan datos epidemiológicos de referencia que ayudan a mejorar nuestra comprensión del papel de los subtipos zoonóticos en la transmisión.