spp. y spp. son dos parásitos intestinales zoonóticos prevalentes que pueden causar diarrea severa y enfermedades intestinales en humanos y muchos animales. La cría de cabras negras es cada vez más importante en China debido a la notable adaptabilidad, alto rendimiento reproductivo, rápida tasa de crecimiento y significativo valor económico de las cabras negras. Varios estudios han indicado que las cabras negras son el reservorio potencial de múltiples protozoos zoonóticos en China; sin embargo, la prevalencia y el estado zoonótico de spp. y spp. en cabras negras en la provincia de Shanxi aún se desconocen. Así, se recolectaron un total de 1200 muestras fecales de cabras negras de varias regiones representativas a diferentes altitudes en la provincia de Shanxi y se examinaron para detectar la presencia y los genotipos de spp. y spp. amplificando los loci de beta-giardina, glutamato deshidrogenasa y triosa fosfato isomerasa de spp. y el SSU rRNA de spp. utilizando métodos de PCR y análisis de secuencias, respectivamente. La prevalencia general de spp. y spp. en cabras negras en la provincia de Shanxi fue del 7.5% y 3.5%, respectivamente. Se identificaron dos ensamblajes (B y E) y cuatro subtipos (ST5, ST10, ST14 y ST30) de spp., siendo el ensamblaje E y el ST10 el genotipo y subtipo prevalentes en cabras negras, respectivamente. Se identificó un nuevo genotipo multilocus (MLG) en MLG-E y se designó como MLG-E12. Para spp. y spp., la prevalencia estuvo significativamente relacionada con la región y los grupos de edad ( < 0.05). Este es el primer informe sobre la prevalencia de spp. y spp. en cabras negras en la provincia de Shanxi. Estos resultados no solo proporcionan datos de referencia para la prevención y control de ambos parásitos en cabras negras en la provincia de Shanxi, sino que también mejoran nuestra comprensión de la composición genética y el potencial zoonótico de estos dos parásitos.