Caracterización a Nivel Genómico de la Familia de Genes Transportadores de Sulfato en Cultivos Oleaginosos: y
Autores: Heidari, Parviz; Hasanzadeh, Soosan; Faraji, Sahar; Ercisli, Sezai; Mora-Poblete, Freddy
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Caracterización a Nivel Genómico de la Familia de Genes Transportadores de Sulfato en Cultivos Oleaginosos: y
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Transportadores de sulfato
Genomas
Cultivos oleaginosos
Relaciones filogenéticas
Niveles de expresión
Eventos de duplicación
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 10
Citaciones: Sin citaciones
Los transportadores de sulfato (SULTRs) son responsables de la absorción de iones de sulfato (SO) en la rizosfera por las raíces y su distribución a los órganos de la planta. En este estudio, se identificaron y caracterizaron los miembros de la familia SULTR en los genomas de dos cultivos oleaginosos. En total, se reconocieron 36 y 45 genes putativos en los genomas de los cultivos, respectivamente. Se predijo que las proteínas SULTR son proteínas basofílicas con baja hidrofobicidad en ambas especies estudiadas. Según las relaciones filogenéticas observadas, dividimos los SULTR en cinco grupos, de los cuales el grupo SULTR 3 mostró la mayor variación. Además, se observaron varios eventos de duplicación entre los cultivos. El primer evento de duplicación ocurrió hace aproximadamente cinco millones de años entre tres genes. Además, se identificaron dos subunidades en las estructuras 3D de los SULTR, que demostraron que los sitios de unión activos diferían entre los cultivos. Según los datos de RNA-seq disponibles, los cultivos mostraron diversos niveles de expresión en los tejidos y diversas respuestas a estímulos. Uno de los cultivos se expresó en todos los tejidos. Otro cultivo se reguló al alza en respuesta a estrés abiótico, mientras que otros se regularon al alza en respuesta a estrés biótico. Además, los datos de qPCR mostraron que los genes en uno de los cultivos estaban involucrados en la respuesta de la planta a la salinidad. Basándonos en la distribución de elementos cis-reguladores en la región promotora, especulamos que podría estar controlado por fitohormonas, como ABA y MeJA. Por lo tanto, parece probable que los genes en el cultivo hayan sido más influenciados por procesos evolutivos y hayan adquirido mayor diversidad. Los resultados revelan nuevas perspectivas sobre las estructuras y funciones de los SULTR en los cultivos oleaginosos. Sin embargo, se necesitan más análisis, relacionados con estudios funcionales, para descubrir el papel de los SULTR en los procesos de desarrollo y crecimiento de las plantas, así como en su respuesta a estímulos.
Descripción
Los transportadores de sulfato (SULTRs) son responsables de la absorción de iones de sulfato (SO) en la rizosfera por las raíces y su distribución a los órganos de la planta. En este estudio, se identificaron y caracterizaron los miembros de la familia SULTR en los genomas de dos cultivos oleaginosos. En total, se reconocieron 36 y 45 genes putativos en los genomas de los cultivos, respectivamente. Se predijo que las proteínas SULTR son proteínas basofílicas con baja hidrofobicidad en ambas especies estudiadas. Según las relaciones filogenéticas observadas, dividimos los SULTR en cinco grupos, de los cuales el grupo SULTR 3 mostró la mayor variación. Además, se observaron varios eventos de duplicación entre los cultivos. El primer evento de duplicación ocurrió hace aproximadamente cinco millones de años entre tres genes. Además, se identificaron dos subunidades en las estructuras 3D de los SULTR, que demostraron que los sitios de unión activos diferían entre los cultivos. Según los datos de RNA-seq disponibles, los cultivos mostraron diversos niveles de expresión en los tejidos y diversas respuestas a estímulos. Uno de los cultivos se expresó en todos los tejidos. Otro cultivo se reguló al alza en respuesta a estrés abiótico, mientras que otros se regularon al alza en respuesta a estrés biótico. Además, los datos de qPCR mostraron que los genes en uno de los cultivos estaban involucrados en la respuesta de la planta a la salinidad. Basándonos en la distribución de elementos cis-reguladores en la región promotora, especulamos que podría estar controlado por fitohormonas, como ABA y MeJA. Por lo tanto, parece probable que los genes en el cultivo hayan sido más influenciados por procesos evolutivos y hayan adquirido mayor diversidad. Los resultados revelan nuevas perspectivas sobre las estructuras y funciones de los SULTR en los cultivos oleaginosos. Sin embargo, se necesitan más análisis, relacionados con estudios funcionales, para descubrir el papel de los SULTR en los procesos de desarrollo y crecimiento de las plantas, así como en su respuesta a estímulos.