Identificación de los genes de Trehalosa-6-Fosfato Sintasa (TPS) asociados tanto con rasgos de rendimiento relacionados con fuente/sumidero como con la respuesta a la sequía en colza (L.)
Autores: Yang, Bo; Zhang, Liyuan; Xiang, Sirou; Chen, Huan; Qu, Cunmin; Lu, Kun; Li, Jiana
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Identificación de los genes de Trehalosa-6-Fosfato Sintasa (TPS) asociados tanto con rasgos de rendimiento relacionados con fuente/sumidero como con la respuesta a la sequía en colza (L.)
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Enzima
Síntesis
Regulador de señalización
Rendimientos de cultivos
Tolerancia a la desecación
Análisis evolutivo
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 10
Citaciones: Sin citaciones
La trehalosa-6-fosfato sintasa (TPS) es una enzima importante para la síntesis de trehalosa-6-fosfato (T6P). Además de ser un regulador de señalización de la asignación de carbono que mejora los rendimientos de los cultivos, el T6P también desempeña roles esenciales en la tolerancia a la deshidratación. Sin embargo, faltan estudios exhaustivos, como análisis evolutivos, análisis de expresión y clasificación funcional de la familia en colza (L.). Aquí, identificamos 35 s, 14 s y 17 s en plantas crucíferas, que fueron clasificadas en tres subfamilias. El análisis filogenético y sinténico de genes en cuatro especies crucíferas indicó que solo ocurrió eliminación de genes durante su evolución. El análisis combinado filogenético, de propiedades de proteínas y de expresión de los 35 s sugirió que los cambios en las estructuras genéticas podrían haber llevado a cambios en sus perfiles de expresión y a una diferenciación funcional adicional durante su evolución. Además, analizamos un conjunto de datos de transcriptoma de Zhongshuang11 (ZS11) y dos conjuntos de datos de materiales extremos asociados con rasgos de rendimiento relacionados con fuente/sumidero y la respuesta a la sequía. Los niveles de expresión de cuatro s (, , , y ) aumentaron drásticamente después del estrés por sequía, y tres genes expresados diferencialmente (, , y ) exhibieron patrones de expresión variables entre tejidos de fuente y sumidero entre materiales relacionados con el rendimiento. Nuestros hallazgos proporcionan una referencia para estudios fundamentales de s en colza y un marco para futuras investigaciones funcionales sobre los roles de BnTPSs tanto en el rendimiento como en la resistencia a la sequía.
Descripción
La trehalosa-6-fosfato sintasa (TPS) es una enzima importante para la síntesis de trehalosa-6-fosfato (T6P). Además de ser un regulador de señalización de la asignación de carbono que mejora los rendimientos de los cultivos, el T6P también desempeña roles esenciales en la tolerancia a la deshidratación. Sin embargo, faltan estudios exhaustivos, como análisis evolutivos, análisis de expresión y clasificación funcional de la familia en colza (L.). Aquí, identificamos 35 s, 14 s y 17 s en plantas crucíferas, que fueron clasificadas en tres subfamilias. El análisis filogenético y sinténico de genes en cuatro especies crucíferas indicó que solo ocurrió eliminación de genes durante su evolución. El análisis combinado filogenético, de propiedades de proteínas y de expresión de los 35 s sugirió que los cambios en las estructuras genéticas podrían haber llevado a cambios en sus perfiles de expresión y a una diferenciación funcional adicional durante su evolución. Además, analizamos un conjunto de datos de transcriptoma de Zhongshuang11 (ZS11) y dos conjuntos de datos de materiales extremos asociados con rasgos de rendimiento relacionados con fuente/sumidero y la respuesta a la sequía. Los niveles de expresión de cuatro s (, , , y ) aumentaron drásticamente después del estrés por sequía, y tres genes expresados diferencialmente (, , y ) exhibieron patrones de expresión variables entre tejidos de fuente y sumidero entre materiales relacionados con el rendimiento. Nuestros hallazgos proporcionan una referencia para estudios fundamentales de s en colza y un marco para futuras investigaciones funcionales sobre los roles de BnTPSs tanto en el rendimiento como en la resistencia a la sequía.