Identificación y análisis de genes de la familia SOD en maní (A. hypogaea) y sus posibles roles en respuestas al estrés
Autores: Yu, Shutao; Wang, Chuantang; Wang, Qi; Sun, Quanxi; Zhang, Yu; Dong, Jingchao; Yin, Yechao; Zhang, Shihang; Yu, Guoqing
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Identificación y análisis de genes de la familia SOD en maní (A. hypogaea) y sus posibles roles en respuestas al estrés
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
Sod
Familia de genes
Genoma de cacahuete
Estrés
Diversidad de expresión
Factores de transcripción
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 32
Citaciones: Sin citaciones
Las superóxido dismutasas (SODs) son cruciales para proteger a las plantas contra la toxicidad de especies reactivas de oxígeno (ROS) causada por factores abióticos o bióticos. Aunque investigaciones recientes han revelado la participación de la familia de genes en procesos biológicos de plantas, la comprensión de la familia de genes en el maní sigue siendo insuficiente. Este estudio caracteriza de manera integral la familia de genes en el genoma del maní. Se identificaron un total de 25 genes y posteriormente se categorizaron en tres subfamilias: dieciséis AhCSDs, seis AhFSDs y tres AhMSDs según el árbol filogenético. Un análisis exhaustivo reveló que los genes experimentaron duplicaciones segmentarias. La mayoría de los genes exhibieron estructuras conservadas de exones-intrones y motivos dentro de la misma subfamilia. El examen de elementos -actuantes dentro de las regiones promotoras de los genes reveló que la expresión estaba sujeta a regulación por hormonas vegetales, así como respuestas a defensa y estrés. El análisis de ARN-seq mostró diversidad de expresión de genes en varios tejidos y en frío, sequía y estrés salino. Además, se anticipa que la regulación de la expresión génica involucre numerosos factores de transcripción. Los resultados de la anotación de la ontología génica validan el papel de los genes en varios estímulos de estrés, actividad de SOD, procesos metabólicos de especies reactivas de oxígeno y procesos de desintoxicación de oxidantes celulares. Esta investigación sirve como el análisis inicial a nivel genómico de la familia de genes, proporcionando una base para comprender la función de la familia de genes y mejorar la tolerancia de las plantas al frío, la sequía y el estrés salino.
Descripción
Las superóxido dismutasas (SODs) son cruciales para proteger a las plantas contra la toxicidad de especies reactivas de oxígeno (ROS) causada por factores abióticos o bióticos. Aunque investigaciones recientes han revelado la participación de la familia de genes en procesos biológicos de plantas, la comprensión de la familia de genes en el maní sigue siendo insuficiente. Este estudio caracteriza de manera integral la familia de genes en el genoma del maní. Se identificaron un total de 25 genes y posteriormente se categorizaron en tres subfamilias: dieciséis AhCSDs, seis AhFSDs y tres AhMSDs según el árbol filogenético. Un análisis exhaustivo reveló que los genes experimentaron duplicaciones segmentarias. La mayoría de los genes exhibieron estructuras conservadas de exones-intrones y motivos dentro de la misma subfamilia. El examen de elementos -actuantes dentro de las regiones promotoras de los genes reveló que la expresión estaba sujeta a regulación por hormonas vegetales, así como respuestas a defensa y estrés. El análisis de ARN-seq mostró diversidad de expresión de genes en varios tejidos y en frío, sequía y estrés salino. Además, se anticipa que la regulación de la expresión génica involucre numerosos factores de transcripción. Los resultados de la anotación de la ontología génica validan el papel de los genes en varios estímulos de estrés, actividad de SOD, procesos metabólicos de especies reactivas de oxígeno y procesos de desintoxicación de oxidantes celulares. Esta investigación sirve como el análisis inicial a nivel genómico de la familia de genes, proporcionando una base para comprender la función de la familia de genes y mejorar la tolerancia de las plantas al frío, la sequía y el estrés salino.