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Identificación a Nivel Genómico, Filogenia y Análisis de Expresión de la Familia de Genes Subtilisina (SBT) bajo Estrés Biótico y Abiótico en Trigo

Autores: Zhao, Xiaotong; Goher, Farhan; Chen, Lei; Song, Jiancheng; Zhao, Jiqiang

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2023

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Acceso abierto

Artículo científico
2023

Identificación a Nivel Genómico, Filogenia y Análisis de Expresión de la Familia de Genes Subtilisina (SBT) bajo Estrés Biótico y Abiótico en Trigo


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Botánica

Palabras clave

Proteasa similar a subtilisina
Resistencia al estrés
Trigo
Proteasas de serina
Familia de genes
RNA-seq

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 8

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
La familia de proteasas similares a subtilisina (SBT) es ampliamente conocida por su papel en la resistencia al estrés frente a varios estresores en diferentes especies de plantas, pero rara vez se estudia en el trigo. Las proteasas serinas similares a subtilisina (SBT) son enzimas proteolíticas serinas que hidrolizan proteínas en péptidos pequeños, que se unen a receptores como moléculas de señal o ligandos y participan en la transducción de señales. En este estudio, identificamos 255 genes SBT putativos del genoma de referencia del trigo y luego los dividimos en siete clados. Posteriormente, realizamos un análisis de relación sinténica, organización de exones e intrones, composición de motivos y análisis de elementos. Además, el análisis de expresión basado en RNA-seq y los patrones de expresión específicos de tejidos revelaron que la expresión de la familia de genes tiene múltiples funciones intrínsecas durante varios estreses abióticos y bióticos. El análisis de ensayos de expresión de RNA-seq y la validación adicional a través de qRT PCR sugirieron que algunos de los genes tienen cambios significativos en los niveles de expresión durante la interacción. Los genes mostraron niveles de expresión crecientes durante interacciones compatibles y no compatibles, mientras que los niveles de expresión de otros mostraron una tendencia a la baja, lo que indica que estos miembros de la familia de genes del trigo pueden tener un papel en la defensa del trigo contra patógenos. En conclusión, estos resultados amplían nuestra comprensión de la familia de genes y proporcionan una referencia valiosa para futuras investigaciones sobre la función de resistencia al estrés y datos completos de los miembros SBT del trigo.

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