Genes de Regulación Dinámica en los Extremos Positivos de los Microtúbulos: Una Nueva Clase de Biomarcadores de Glioma
Autores: Wang, Wenwen; Li, Weilong; Pan, Lifang; Li, Lingjie; Xu, Yasi; Wang, Yuqing; Zhang, Xiaochen; Zhang, Shirong
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Genes de Regulación Dinámica en los Extremos Positivos de los Microtúbulos: Una Nueva Clase de Biomarcadores de Glioma
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Glioma
Mpergs
Genes
Firma
Pronóstico
Tumor
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 20
Citaciones: Sin citaciones
El glioma es el tumor primario del sistema nervioso más prevalente y agresivo, con un pronóstico desfavorable. Los genes relacionados con el extremo positivo de los microtúbulos (MPERGs) desempeñan roles biológicos críticos en el ciclo celular, el movimiento celular, la ciliogénesis y el desarrollo neuronal al coordinar el ensamblaje y la dinámica de los microtúbulos. Esta investigación busca explorar sistemáticamente las características oncológicas de estos genes en gliomas enriquecidos en microtúbulos, centrándose en desarrollar una nueva firma pronóstica basada en MPERG para mejorar el pronóstico y proporcionar más opciones de tratamiento para los pacientes con glioma. Primero, analizamos y identificamos exhaustivamente 45 MPERGs expresados diferencialmente en glioma. Basándonos en estos genes, los pacientes con glioma se distinguieron bien en dos subgrupos con diferencias en la supervivencia y la infiltración del microambiente tumoral. A continuación, filtramos más los genes pronósticos independientes utilizando 36 MPERGs expresados diferencialmente relacionados con el pronóstico para construir una firma con capacidad de estratificación de riesgo y predicción pronóstica. Un aumento en la puntuación de riesgo se relacionó con la progresión maligna del glioma. Por lo tanto, también diseñamos un modelo de nomograma que contiene factores clínicos para facilitar el uso clínico de la firma de riesgo. La precisión de predicción de la firma y el modelo de nomograma se verificó utilizando los conjuntos de datos de The Cancer Genome Atlas y el Chinese Glioma Genome Atlas. Finalmente, examinamos la conexión entre la firma y el microambiente tumoral. La firma se correlacionó positivamente con la infiltración del microambiente tumoral, especialmente con los inmunoinhibidores y la carga mutacional del tumor, y se correlacionó negativamente con la inestabilidad de microsatélites y la naturaleza de las células madre cancerosas. Más importante aún, el tratamiento con bloqueo de puntos de control inmunitario y los análisis de sensibilidad a fármacos confirmaron que esta firma pronóstica era útil para anticipar el efecto de la inmunoterapia y la quimioterapia. En conclusión, esta investigación es el primer estudio en definir y validar una firma basada en MPERG estrechamente asociada con el microambiente tumoral como un biomarcador pronóstico confiable e independiente para guiar las elecciones personalizadas de inmunoterapia y quimioterapia para los pacientes con glioma.
Descripción
El glioma es el tumor primario del sistema nervioso más prevalente y agresivo, con un pronóstico desfavorable. Los genes relacionados con el extremo positivo de los microtúbulos (MPERGs) desempeñan roles biológicos críticos en el ciclo celular, el movimiento celular, la ciliogénesis y el desarrollo neuronal al coordinar el ensamblaje y la dinámica de los microtúbulos. Esta investigación busca explorar sistemáticamente las características oncológicas de estos genes en gliomas enriquecidos en microtúbulos, centrándose en desarrollar una nueva firma pronóstica basada en MPERG para mejorar el pronóstico y proporcionar más opciones de tratamiento para los pacientes con glioma. Primero, analizamos y identificamos exhaustivamente 45 MPERGs expresados diferencialmente en glioma. Basándonos en estos genes, los pacientes con glioma se distinguieron bien en dos subgrupos con diferencias en la supervivencia y la infiltración del microambiente tumoral. A continuación, filtramos más los genes pronósticos independientes utilizando 36 MPERGs expresados diferencialmente relacionados con el pronóstico para construir una firma con capacidad de estratificación de riesgo y predicción pronóstica. Un aumento en la puntuación de riesgo se relacionó con la progresión maligna del glioma. Por lo tanto, también diseñamos un modelo de nomograma que contiene factores clínicos para facilitar el uso clínico de la firma de riesgo. La precisión de predicción de la firma y el modelo de nomograma se verificó utilizando los conjuntos de datos de The Cancer Genome Atlas y el Chinese Glioma Genome Atlas. Finalmente, examinamos la conexión entre la firma y el microambiente tumoral. La firma se correlacionó positivamente con la infiltración del microambiente tumoral, especialmente con los inmunoinhibidores y la carga mutacional del tumor, y se correlacionó negativamente con la inestabilidad de microsatélites y la naturaleza de las células madre cancerosas. Más importante aún, el tratamiento con bloqueo de puntos de control inmunitario y los análisis de sensibilidad a fármacos confirmaron que esta firma pronóstica era útil para anticipar el efecto de la inmunoterapia y la quimioterapia. En conclusión, esta investigación es el primer estudio en definir y validar una firma basada en MPERG estrechamente asociada con el microambiente tumoral como un biomarcador pronóstico confiable e independiente para guiar las elecciones personalizadas de inmunoterapia y quimioterapia para los pacientes con glioma.