El análisis del transcriptoma revela genes candidatos que regulan la diversidad de la piel y el cabello de las ovejas Xinji Fine-Wool y Tan
Autores: Bai, Tianyou; Liang, Benmeng; Zhao, Yuhetian; Han, Jiangang; Pu, Yabin; Wang, Chunxin; Ma, Yuehui; Jiang, Lin
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2021
Acceso abierto
Artículo científico
2021
El análisis del transcriptoma revela genes candidatos que regulan la diversidad de la piel y el cabello de las ovejas Xinji Fine-Wool y Tan
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas Generales
Palabras clave
Folículo piloso
Desarrollo de la piel
Análisis transcriptómico
Regulación génica
Modelo ovino
Etapas de crecimiento
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 25
Citaciones: Sin citaciones
El folículo piloso es un miniórgano complejo en la piel que experimenta inducción de órganos, morfogénesis y regeneración. Sin embargo, el mecanismo molecular preciso de la regulación de la diversidad de la piel y el cabello sigue siendo esquivo. La oveja es un modelo animal que se puede utilizar para explorar más a fondo los mecanismos de diversidad de la piel y el cabello. En este estudio, llevamos a cabo un análisis transcriptómico de la expresión de ARNm en la piel de ovejas de lana fina de Xinji en diferentes etapas de crecimiento (3 y 12 meses de edad) y ovejas Tan de 12 meses, y exploramos la relación de los transcritos con el crecimiento del folículo piloso. Se identificaron un total de 1327 ARNm y 67 factores de transcripción que se expresaron diferencialmente en las diferentes razas y durante diferentes períodos de desarrollo de la piel. Los genes expresados diferencialmente se enriquecieron en términos de GO representados por desarrollo del sistema, desarrollo de organismos multicelulares, desarrollo de órganos animales y desarrollo de la piel, y tres vías de KEGG tipificaron aquellas que rigen las diferencias en la estructura de la piel. Combinando redes de interacción proteína-proteína del desarrollo de la piel (GO:0043588) y anotación funcional, se confirmó que nueve genes candidatos importantes, a saber, , , , , , , , , y , y muchos genes centrales con efectos menores estaban asociados con el desarrollo del folículo piloso. Además, los miembros de las familias de factores de transcripción zf-C2H2 y homeobox, que se identificaron como desempeñando un papel crucial en la producción de lana más fina y densa, se expresaron principalmente al alza en ovejas de lana fina de Xinji de 12 meses en comparación con la expresión en ovejas Tan de 12 meses y ovejas de lana fina de Xinji de 3 meses. Este estudio reveló las interacciones gen-gen mayores-menores en la vía de desarrollo y proporcionó ideas para una comprensión más profunda de la estructura genética y la regulación génica en el proceso de crecimiento de la piel/cabello.
Descripción
El folículo piloso es un miniórgano complejo en la piel que experimenta inducción de órganos, morfogénesis y regeneración. Sin embargo, el mecanismo molecular preciso de la regulación de la diversidad de la piel y el cabello sigue siendo esquivo. La oveja es un modelo animal que se puede utilizar para explorar más a fondo los mecanismos de diversidad de la piel y el cabello. En este estudio, llevamos a cabo un análisis transcriptómico de la expresión de ARNm en la piel de ovejas de lana fina de Xinji en diferentes etapas de crecimiento (3 y 12 meses de edad) y ovejas Tan de 12 meses, y exploramos la relación de los transcritos con el crecimiento del folículo piloso. Se identificaron un total de 1327 ARNm y 67 factores de transcripción que se expresaron diferencialmente en las diferentes razas y durante diferentes períodos de desarrollo de la piel. Los genes expresados diferencialmente se enriquecieron en términos de GO representados por desarrollo del sistema, desarrollo de organismos multicelulares, desarrollo de órganos animales y desarrollo de la piel, y tres vías de KEGG tipificaron aquellas que rigen las diferencias en la estructura de la piel. Combinando redes de interacción proteína-proteína del desarrollo de la piel (GO:0043588) y anotación funcional, se confirmó que nueve genes candidatos importantes, a saber, , , , , , , , , y , y muchos genes centrales con efectos menores estaban asociados con el desarrollo del folículo piloso. Además, los miembros de las familias de factores de transcripción zf-C2H2 y homeobox, que se identificaron como desempeñando un papel crucial en la producción de lana más fina y densa, se expresaron principalmente al alza en ovejas de lana fina de Xinji de 12 meses en comparación con la expresión en ovejas Tan de 12 meses y ovejas de lana fina de Xinji de 3 meses. Este estudio reveló las interacciones gen-gen mayores-menores en la vía de desarrollo y proporcionó ideas para una comprensión más profunda de la estructura genética y la regulación génica en el proceso de crecimiento de la piel/cabello.