Identificación y caracterización a nivel genómico de la familia de genes NAC y su participación en la respuesta al frío en
Autores: Yang, Qianyu; Li, Zhihui; Wang, Xiao; Jiang, Chunqian; Liu, Feihong; Nian, Yuxin; Fu, Xiaoyun; Zhou, Guangzhu; Liu, Lei; Wang, Hui
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Identificación y caracterización a nivel genómico de la familia de genes NAC y su participación en la respuesta al frío en
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Factor de transcripción específico de planta
Respuesta al estrés por frío
Búsqueda a nivel genómico
Subfamilias
Perfiles de expresión
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 12
Citaciones: Sin citaciones
La familia de genes NAC (NAM, ATAF1/2 y CUC2) es una de las familias de factores de transcripción específicos de plantas más grandes, funcionando como reguladores cruciales en diversos procesos biológicos como el crecimiento y desarrollo de las plantas, así como en las respuestas a estrés biótico y abiótico. Aunque ha sido ampliamente caracterizada en muchas plantas, la importancia de la familia NAC ha permanecido elusiva hasta ahora. En este estudio, se llevó a cabo un método de búsqueda a nivel genómico para identificar genes NAC en (DoNACs) y se obtuvieron un total de 110 DoNACs putativos. El análisis filogenético los clasificó en 15 subfamilias de acuerdo con la nomenclatura en Arabidopsis y arroz. Los miembros de las subfamilias compartieron estructuras génicas más similares y composiciones de dominios proteicos conservadas. Además, se investigaron los perfiles de expresión de estos DoNACs en diversos tejidos y bajo estrés por frío mediante datos de RNA-seq. Luego, se validaron un total de cinco DoNACs responsivos al frío, regulados al alza, y cinco regulados a la baja, a través de análisis de QRT-PCR, demostrando que estaban involucrados en la regulación de la respuesta al estrés por frío. Adicionalmente, se demostró que la localización subcelular de dos candidatos regulados a la baja (DoNAC39 y DoNAC58) estaba localizada en los núcleos. Este estudio reportó la organización genómica, las composiciones de dominios proteicos y los patrones de expresión de la familia NAC en , lo que proporcionó objetivos para futuros estudios funcionales de DoNACs y también contribuyó a la disecación del papel de NAC en la regulación de la tolerancia al frío en .
Descripción
La familia de genes NAC (NAM, ATAF1/2 y CUC2) es una de las familias de factores de transcripción específicos de plantas más grandes, funcionando como reguladores cruciales en diversos procesos biológicos como el crecimiento y desarrollo de las plantas, así como en las respuestas a estrés biótico y abiótico. Aunque ha sido ampliamente caracterizada en muchas plantas, la importancia de la familia NAC ha permanecido elusiva hasta ahora. En este estudio, se llevó a cabo un método de búsqueda a nivel genómico para identificar genes NAC en (DoNACs) y se obtuvieron un total de 110 DoNACs putativos. El análisis filogenético los clasificó en 15 subfamilias de acuerdo con la nomenclatura en Arabidopsis y arroz. Los miembros de las subfamilias compartieron estructuras génicas más similares y composiciones de dominios proteicos conservadas. Además, se investigaron los perfiles de expresión de estos DoNACs en diversos tejidos y bajo estrés por frío mediante datos de RNA-seq. Luego, se validaron un total de cinco DoNACs responsivos al frío, regulados al alza, y cinco regulados a la baja, a través de análisis de QRT-PCR, demostrando que estaban involucrados en la regulación de la respuesta al estrés por frío. Adicionalmente, se demostró que la localización subcelular de dos candidatos regulados a la baja (DoNAC39 y DoNAC58) estaba localizada en los núcleos. Este estudio reportó la organización genómica, las composiciones de dominios proteicos y los patrones de expresión de la familia NAC en , lo que proporcionó objetivos para futuros estudios funcionales de DoNACs y también contribuyó a la disecación del papel de NAC en la regulación de la tolerancia al frío en .