Los genes del hub modular en microarrays de ADN sugieren una posible interconectividad de vías de señalización en varios grados de glioma
Autores: Orda, Marco A.; Fowler, Peter Matthew Paul T.; Tayo, Lemmuel L.
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Los genes del hub modular en microarrays de ADN sugieren una posible interconectividad de vías de señalización en varios grados de glioma
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Gliomas
Genes clave
Vías de señalización
Candidatos a fármacos
WGCNA
Base de datos para anotación
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 18
Citaciones: Sin citaciones
Los gliomas han presentado desafíos significativos en oncología debido a su alto grado de invasividad, recurrencia y resistencia a las estrategias de tratamiento. En este trabajo, se identificaron los genes clave principalmente asociados con diferentes grados de glioma, representados por astrocitoma pilocítico (PA), oligodendroglioma (OG), astrocitoma anaplásico (AA) y glioblastoma multiforme (GBM), a través del análisis de red de coexpresión génica ponderada (WGCNA) de conjuntos de datos de microarreglos recuperados de la base de datos Gene Expression Omnibus (GEO). A través de esto, se observaron cuatro módulos altamente correlacionados presentes en los conjuntos de datos de PA (GSE50161), OG (GSE4290), AA (GSE43378) y GBM (GSE36245). La anotación funcional y el análisis de enriquecimiento de vías realizados a través de la Base de Datos para Anotación, Visualización y Descubrimiento Integrado (DAVID) mostraron que los módulos y genes clave identificados estaban principalmente involucrados en la transducción de señales, regulación de la transcripción y unión de proteínas, que en conjunto desregulan varias vías de señalización, principalmente las vías metabólicas y PI3K/Akt. La participación de varios genes clave vinculados principalmente a otras vías de señalización, incluidas las vías de señalización cAMP, MAPK/ERK, Wnt/beta-catenina y de calcio, indica una posible interconectividad e influencia en la vía PI3K/Akt y, posteriormente, en la gravedad del glioma. La Enciclopedia de Reutilización de Medicamentos (DRE) se utilizó para buscar posibles medicamentos basados en los genes clave regulados al alza y a la baja, donde las hormonas progestinas sintéticas norgestimato y etisterona fueron los principales candidatos a fármacos. Esto muestra el potencial efecto neuroprotector de la progesterona contra el glioma debido a su influencia en la expresión de EGFR y otras vías de señalización. Además de estos, también se identificaron varios candidatos a fármacos experimentales y aprobados, que incluyen un antagonista de receptores adrenérgicos, un agonista de receptores PPAR-, un inhibidor de CDK, un bloqueador de canales de sodio, un antagonista de receptores de bradiquinina y un agonista de receptores de dopamina, lo que resalta aún más la red génica como una posible vía terapéutica para el glioma.
Descripción
Los gliomas han presentado desafíos significativos en oncología debido a su alto grado de invasividad, recurrencia y resistencia a las estrategias de tratamiento. En este trabajo, se identificaron los genes clave principalmente asociados con diferentes grados de glioma, representados por astrocitoma pilocítico (PA), oligodendroglioma (OG), astrocitoma anaplásico (AA) y glioblastoma multiforme (GBM), a través del análisis de red de coexpresión génica ponderada (WGCNA) de conjuntos de datos de microarreglos recuperados de la base de datos Gene Expression Omnibus (GEO). A través de esto, se observaron cuatro módulos altamente correlacionados presentes en los conjuntos de datos de PA (GSE50161), OG (GSE4290), AA (GSE43378) y GBM (GSE36245). La anotación funcional y el análisis de enriquecimiento de vías realizados a través de la Base de Datos para Anotación, Visualización y Descubrimiento Integrado (DAVID) mostraron que los módulos y genes clave identificados estaban principalmente involucrados en la transducción de señales, regulación de la transcripción y unión de proteínas, que en conjunto desregulan varias vías de señalización, principalmente las vías metabólicas y PI3K/Akt. La participación de varios genes clave vinculados principalmente a otras vías de señalización, incluidas las vías de señalización cAMP, MAPK/ERK, Wnt/beta-catenina y de calcio, indica una posible interconectividad e influencia en la vía PI3K/Akt y, posteriormente, en la gravedad del glioma. La Enciclopedia de Reutilización de Medicamentos (DRE) se utilizó para buscar posibles medicamentos basados en los genes clave regulados al alza y a la baja, donde las hormonas progestinas sintéticas norgestimato y etisterona fueron los principales candidatos a fármacos. Esto muestra el potencial efecto neuroprotector de la progesterona contra el glioma debido a su influencia en la expresión de EGFR y otras vías de señalización. Además de estos, también se identificaron varios candidatos a fármacos experimentales y aprobados, que incluyen un antagonista de receptores adrenérgicos, un agonista de receptores PPAR-, un inhibidor de CDK, un bloqueador de canales de sodio, un antagonista de receptores de bradiquinina y un agonista de receptores de dopamina, lo que resalta aún más la red génica como una posible vía terapéutica para el glioma.