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Los genes del hub modular en microarrays de ADN sugieren una posible interconectividad de vías de señalización en varios grados de glioma

Autores: Orda, Marco A.; Fowler, Peter Matthew Paul T.; Tayo, Lemmuel L.

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2024

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Acceso abierto

Artículo científico
2024

Los genes del hub modular en microarrays de ADN sugieren una posible interconectividad de vías de señalización en varios grados de glioma


Categoría

Ciencias Naturales y Subdisciplinas

Subcategoría

Biología

Palabras clave

Gliomas
Genes clave
Vías de señalización
Candidatos a fármacos
WGCNA
Base de datos para anotación

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 18

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
Los gliomas han presentado desafíos significativos en oncología debido a su alto grado de invasividad, recurrencia y resistencia a las estrategias de tratamiento. En este trabajo, se identificaron los genes clave principalmente asociados con diferentes grados de glioma, representados por astrocitoma pilocítico (PA), oligodendroglioma (OG), astrocitoma anaplásico (AA) y glioblastoma multiforme (GBM), a través del análisis de red de coexpresión génica ponderada (WGCNA) de conjuntos de datos de microarreglos recuperados de la base de datos Gene Expression Omnibus (GEO). A través de esto, se observaron cuatro módulos altamente correlacionados presentes en los conjuntos de datos de PA (GSE50161), OG (GSE4290), AA (GSE43378) y GBM (GSE36245). La anotación funcional y el análisis de enriquecimiento de vías realizados a través de la Base de Datos para Anotación, Visualización y Descubrimiento Integrado (DAVID) mostraron que los módulos y genes clave identificados estaban principalmente involucrados en la transducción de señales, regulación de la transcripción y unión de proteínas, que en conjunto desregulan varias vías de señalización, principalmente las vías metabólicas y PI3K/Akt. La participación de varios genes clave vinculados principalmente a otras vías de señalización, incluidas las vías de señalización cAMP, MAPK/ERK, Wnt/beta-catenina y de calcio, indica una posible interconectividad e influencia en la vía PI3K/Akt y, posteriormente, en la gravedad del glioma. La Enciclopedia de Reutilización de Medicamentos (DRE) se utilizó para buscar posibles medicamentos basados en los genes clave regulados al alza y a la baja, donde las hormonas progestinas sintéticas norgestimato y etisterona fueron los principales candidatos a fármacos. Esto muestra el potencial efecto neuroprotector de la progesterona contra el glioma debido a su influencia en la expresión de EGFR y otras vías de señalización. Además de estos, también se identificaron varios candidatos a fármacos experimentales y aprobados, que incluyen un antagonista de receptores adrenérgicos, un agonista de receptores PPAR-, un inhibidor de CDK, un bloqueador de canales de sodio, un antagonista de receptores de bradiquinina y un agonista de receptores de dopamina, lo que resalta aún más la red génica como una posible vía terapéutica para el glioma.

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